174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3146 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3146  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 134 aa  270  5.000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.94 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1305  cupin 2, barrel  40.58 
 
 		 115 aa  62.4  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0335072  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3858  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0134  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.57 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.41 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  30.34 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3716  cupin 2, barrel  31.43 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000701811  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1285  cupin region  34.52 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  28.21 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4715  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.83 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0223  cupin 2 domain-containing protein  30.11 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2629  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.72 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.21 
 
 		 163 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1816  cupin 2 domain-containing protein  31.96 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.337557  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0580  hypothetical protein  35.21 
 
 		 160 aa  51.2  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2010  cupin domain-containing protein  35.71 
 
 		 153 aa  51.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1917  cupin domain-containing protein  35.71 
 
 		 153 aa  51.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1358  cupin 2 domain-containing protein  29.29 
 
 		 119 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.660301  normal  0.0940885 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.99 
 
 		 192 aa  51.2  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1915  cupin 2 domain-containing protein  36.47 
 
 		 129 aa  51.6  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4843  cupin 2 domain-containing protein  35.58 
 
 		 182 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.45501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0435  cupin domain-containing protein  35.21 
 
 		 160 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1397  cupin 2 domain-containing protein  33.63 
 
 		 115 aa  51.2  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0319163  normal  0.27943 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4993  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.43 
 
 		 137 aa  50.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391501  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1265  transcriptional regulator, putative  40 
 
 		 182 aa  50.4  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3195  transcriptional regulator, XRE family  38.95 
 
 		 182 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0639399 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1104  cupin 2 domain-containing protein  38.95 
 
 		 182 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.183758  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1163  cupin 2 domain-containing protein  38.95 
 
 		 182 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.967119  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1195  XRE family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 182 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.152731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3773  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.31 
 
 		 421 aa  50.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.239832  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2409  cupin family protein  30.16 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116838  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4456  hypothetical protein  28.95 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0285903  normal  0.0443513 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2863  cupin 2, barrel  33.75 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1009  cupin family protein  26.88 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1177  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.94 
 
 		 152 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0887  hypothetical protein  34.29 
 
 		 153 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1854  hypothetical protein  33.8 
 
 		 160 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2162  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.31 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000761945  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3273  methionyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 		 662 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.433163 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1091  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 182 aa  48.5  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.158888  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1488  cupin 2 domain-containing protein  31.94 
 
 		 115 aa  48.9  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00804045  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3791  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.18 
 
 		 159 aa  48.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302037  normal  0.0222415 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0817  transcriptional regulator, XRE family  35.21 
 
 		 184 aa  48.1  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8561  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.41 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853837  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2921  XRE family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 208 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.899455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3003  XRE family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 208 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3100  XRE family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 208 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.510523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2790  cupin 2 domain-containing protein  32.65 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3018  cupin 2 domain-containing protein  33.65 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.609339  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5854  cupin 2 domain-containing protein  31.53 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.154077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3156  cupin 2 domain-containing protein  31.15 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1532  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4521  hypothetical protein  28.07 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1030  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.82 
 
 		 172 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2004  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.94 
 
 		 141 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2411  cupin 2 domain-containing protein  32.05 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0389  cupin 2 domain-containing protein  30.95 
 
 		 122 aa  47.4  0.00006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2394  cupin 2 domain-containing protein  28.42 
 
 		 151 aa  47  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00264239  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2148  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.05 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0024464  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4894  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.73 
 
 		 177 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13508  hypothetical protein  33.33 
 
 		 177 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1333  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.73 
 
 		 180 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.861025  normal  0.798178 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1173  cupin 2 domain-containing protein  31.73 
 
 		 180 aa  47  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0388903  normal  0.0358477 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1033  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.65 
 
 		 172 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.714129  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1827  hypothetical protein  26.37 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2502  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.76 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.529336 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0587  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.55 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.90971 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000921  putative pectin degradation protein  29.25 
 
 		 109 aa  45.4  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1871  putative HTH-type transcriptional regulator  38.98 
 
 		 215 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0589891  normal  0.573197 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5111  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.69 
 
 		 167 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0577  cupin 2 domain-containing protein  43.55 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.210355  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2672  hypothetical protein  32.94 
 
 		 159 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.311364  normal  0.391613 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2847  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.77 
 
 		 119 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1270  hypothetical protein  28.87 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2249  cupin 2, barrel  27.59 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2646  XRE family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 182 aa  44.7  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0970  XRE family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 182 aa  44.7  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0943  XRE family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 182 aa  45.1  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2075  cupin region  27.18 
 
 		 135 aa  44.3  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.626152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0837  cupin 2 domain-containing protein  29.87 
 
 		 125 aa  44.3  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168826 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0780  cupin 2 domain-containing protein  40 
 
 		 106 aa  44.7  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2685  cupin 2 domain-containing protein  30 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477579  hitchhiker  0.0004758 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.76 
 
 		 159 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1685  cupin 2 domain-containing protein  38.71 
 
 		 141 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2609  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.29 
 
 		 160 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0992  cupin 2 domain-containing protein  37.74 
 
 		 186 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00214756  normal  0.392819 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0411  L-ectoine synthase  36.23 
 
 		 138 aa  44.3  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478719  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1941  transcriptional regulator  32 
 
 		 225 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.55 
 
 		 132 aa  44.3  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2094  transcriptional regulator Cro/CI family protein  30.67 
 
 		 188 aa  43.9  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0971  cupin domain-containing protein  36.47 
 
 		 171 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.341283  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0602  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.96 
 
 		 118 aa  43.9  0.0007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1904  cupin region  27.96 
 
 		 120 aa  43.9  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0542  cupin 2, barrel  34.21 
 
 		 122 aa  43.5  0.0009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0248  XRE family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 182 aa  43.9  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5786  cupin 2 conserved barrel domain protein  32.22 
 
 		 135 aa  43.5  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242076  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3867  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.47 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.468547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0104  cupin  27.84 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.300673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4136  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.03 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>