46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0411 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0411  L-ectoine synthase  100 
 
 		 138 aa  291  2e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478719  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003603  L-ectoine synthase  82.54 
 
 		 128 aa  226  9e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02452  L-ectoine synthase  81.75 
 
 		 128 aa  224  3e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1191  L-ectoine synthase  65.15 
 
 		 132 aa  191  3e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.600965 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1028  L-ectoine synthase  61.42 
 
 		 133 aa  171  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1160  L-ectoine synthase  58.59 
 
 		 129 aa  159  9e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.341721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1344  L-ectoine synthase  58.4 
 
 		 128 aa  159  9e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0137023 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3010  L-ectoine synthase  56 
 
 		 132 aa  159  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1878  L-ectoine synthase  56.92 
 
 		 130 aa  156  7e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0095983  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1734  L-ectoine synthase  58.4 
 
 		 126 aa  149  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.528654  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2951  L-ectoine synthase  49.61 
 
 		 137 aa  145  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.748451 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0196  L-ectoine synthase  53.49 
 
 		 135 aa  136  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0553  L-ectoine synthase  50.81 
 
 		 130 aa  134  4e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.988987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0960  L-ectoine synthase  50 
 
 		 129 aa  133  9e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.612167  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34790  L-ectoine synthase  48.41 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.220713 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2796  L-ectoine synthase  46.09 
 
 		 128 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2064  Ectoine synthase  49.22 
 
 		 142 aa  127  5.0000000000000004e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0302  L-ectoine synthase  46.83 
 
 		 134 aa  124  5e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4192  L-ectoine synthase  46.4 
 
 		 129 aa  124  6e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.017142  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4258  L-ectoine synthase  46.4 
 
 		 129 aa  124  6e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0665619  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5813  Ectoine synthase  48.87 
 
 		 139 aa  123  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5214  Ectoine synthase  46.03 
 
 		 131 aa  123  7e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.285103 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4419  L-ectoine synthase  46.4 
 
 		 132 aa  123  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.750905  normal  0.504417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5272  L-ectoine synthase  47.2 
 
 		 130 aa  123  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.733165 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24820  L-ectoine synthase  45.24 
 
 		 130 aa  122  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.383396  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2638  L-ectoine synthase  48.74 
 
 		 128 aa  122  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.766502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0079  L-ectoine synthase  47.29 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4834  L-ectoine synthase  47.2 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0578  L-ectoine synthase  48.74 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0616  L-ectoine synthase  43.85 
 
 		 131 aa  121  4e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0444  L-ectoine synthase  46.51 
 
 		 131 aa  120  4e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2621  Ectoine synthase  46.62 
 
 		 142 aa  120  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.982438 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1555  Ectoine synthase  46.83 
 
 		 130 aa  120  7e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4451  L-ectoine synthase  42.86 
 
 		 132 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5030  L-ectoine synthase  44.63 
 
 		 128 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.192143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4085  L-ectoine synthase  39.39 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3987  L-ectoine synthase  42.06 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.222162 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1190  L-ectoine synthase  45.24 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192076 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1110  L-ectoine synthase  37.9 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19660  L-ectoine synthase  43.08 
 
 		 138 aa  107  4.0000000000000004e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.942156  decreased coverage  0.00151851 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0520  L-ectoine synthase  44.53 
 
 		 131 aa  107  5e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0334  L-ectoine synthase  42.86 
 
 		 128 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.981296 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02920  L-ectoine synthase  35.19 
 
 		 137 aa  78.6  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.63 
 
 		 257 aa  45.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3146  cupin 2 domain-containing protein  36.23 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3232  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.44 
 
 		 128 aa  40.4  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>