43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0553 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0553  L-ectoine synthase  100 
 
 		 130 aa  274  2e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.988987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2951  L-ectoine synthase  57.69 
 
 		 137 aa  167  5e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.748451 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0960  L-ectoine synthase  58.14 
 
 		 129 aa  164  4e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.612167  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3010  L-ectoine synthase  53.97 
 
 		 132 aa  158  3e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0444  L-ectoine synthase  59.2 
 
 		 131 aa  157  4e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1028  L-ectoine synthase  55.28 
 
 		 133 aa  156  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0616  L-ectoine synthase  57.26 
 
 		 131 aa  154  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1191  L-ectoine synthase  54.47 
 
 		 132 aa  154  5.0000000000000005e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.600965 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003603  L-ectoine synthase  54.4 
 
 		 128 aa  145  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1878  L-ectoine synthase  52.31 
 
 		 130 aa  145  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0095983  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4451  L-ectoine synthase  51.52 
 
 		 132 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3987  L-ectoine synthase  51.52 
 
 		 132 aa  144  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.222162 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1160  L-ectoine synthase  51.16 
 
 		 129 aa  143  7.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.341721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2621  Ectoine synthase  53.38 
 
 		 142 aa  142  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.982438 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02452  L-ectoine synthase  53.6 
 
 		 128 aa  143  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0079  L-ectoine synthase  55.2 
 
 		 131 aa  142  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4085  L-ectoine synthase  52.34 
 
 		 132 aa  140  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4834  L-ectoine synthase  49.21 
 
 		 130 aa  140  5e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5272  L-ectoine synthase  48.41 
 
 		 130 aa  140  6e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.733165 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1734  L-ectoine synthase  51.22 
 
 		 126 aa  137  4.999999999999999e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.528654  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1344  L-ectoine synthase  50 
 
 		 128 aa  134  4e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0137023 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0411  L-ectoine synthase  50.81 
 
 		 138 aa  134  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478719  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4192  L-ectoine synthase  49.59 
 
 		 129 aa  134  5e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.017142  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4258  L-ectoine synthase  49.59 
 
 		 129 aa  134  5e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0665619  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24820  L-ectoine synthase  48.78 
 
 		 130 aa  133  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.383396  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19660  L-ectoine synthase  50.41 
 
 		 138 aa  133  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.942156  decreased coverage  0.00151851 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2064  Ectoine synthase  48 
 
 		 142 aa  132  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2796  L-ectoine synthase  50 
 
 		 128 aa  132  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4419  L-ectoine synthase  48.78 
 
 		 132 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.750905  normal  0.504417 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1190  L-ectoine synthase  49.61 
 
 		 132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192076 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34790  L-ectoine synthase  47.15 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.220713 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0196  L-ectoine synthase  50.39 
 
 		 135 aa  130  6e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0302  L-ectoine synthase  47.97 
 
 		 134 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5813  Ectoine synthase  46.92 
 
 		 139 aa  128  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5214  Ectoine synthase  47.15 
 
 		 131 aa  128  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.285103 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0520  L-ectoine synthase  48.85 
 
 		 131 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1555  Ectoine synthase  43.9 
 
 		 130 aa  123  7e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1110  L-ectoine synthase  39.68 
 
 		 137 aa  118  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2638  L-ectoine synthase  42.86 
 
 		 128 aa  100  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.766502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0334  L-ectoine synthase  39.2 
 
 		 128 aa  93.6  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.981296 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0578  L-ectoine synthase  39.5 
 
 		 128 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02920  L-ectoine synthase  41.18 
 
 		 137 aa  90.9  6e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5030  L-ectoine synthase  35.94 
 
 		 128 aa  89  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.192143  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>