44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1878 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1878  L-ectoine synthase  100 
 
 
130 aa  272  1.0000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0095983  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003603  L-ectoine synthase  58.78 
 
 
128 aa  159  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02452  L-ectoine synthase  58.02 
 
 
128 aa  157  6e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0411  L-ectoine synthase  56.92 
 
 
138 aa  156  7e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478719  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1191  L-ectoine synthase  58.73 
 
 
132 aa  156  9e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.600965 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1028  L-ectoine synthase  56.35 
 
 
133 aa  150  5.9999999999999996e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0553  L-ectoine synthase  52.31 
 
 
130 aa  145  3e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.988987  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0196  L-ectoine synthase  58.27 
 
 
135 aa  144  5e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1160  L-ectoine synthase  53.17 
 
 
129 aa  143  9e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.341721  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3010  L-ectoine synthase  49.22 
 
 
132 aa  132  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2951  L-ectoine synthase  49.23 
 
 
137 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.748451 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4085  L-ectoine synthase  49.61 
 
 
132 aa  129  9e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2796  L-ectoine synthase  46.15 
 
 
128 aa  128  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0960  L-ectoine synthase  50 
 
 
129 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.612167  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1344  L-ectoine synthase  51.97 
 
 
128 aa  124  3e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0137023 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3987  L-ectoine synthase  48.03 
 
 
132 aa  124  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.222162 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2621  Ectoine synthase  47.33 
 
 
142 aa  123  9e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.982438 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4451  L-ectoine synthase  47.24 
 
 
132 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0444  L-ectoine synthase  45.31 
 
 
131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1110  L-ectoine synthase  42.64 
 
 
137 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0616  L-ectoine synthase  45.24 
 
 
131 aa  115  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0079  L-ectoine synthase  43.75 
 
 
131 aa  114  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5272  L-ectoine synthase  46.03 
 
 
130 aa  114  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.733165 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34790  L-ectoine synthase  46.51 
 
 
129 aa  114  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.220713 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24820  L-ectoine synthase  44.96 
 
 
130 aa  114  5e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.383396  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2638  L-ectoine synthase  47.93 
 
 
128 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.766502  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4834  L-ectoine synthase  46.09 
 
 
130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1190  L-ectoine synthase  44.62 
 
 
132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.192076 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5214  Ectoine synthase  47.29 
 
 
131 aa  111  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.285103 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2064  Ectoine synthase  44.96 
 
 
142 aa  110  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5813  Ectoine synthase  47.33 
 
 
139 aa  110  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4258  L-ectoine synthase  46.92 
 
 
129 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0665619  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4192  L-ectoine synthase  46.92 
 
 
129 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.017142  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4419  L-ectoine synthase  46.92 
 
 
132 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.750905  normal  0.504417 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0520  L-ectoine synthase  47.73 
 
 
131 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0302  L-ectoine synthase  48.41 
 
 
134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1734  L-ectoine synthase  43.08 
 
 
126 aa  107  4.0000000000000004e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.528654  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0578  L-ectoine synthase  45.45 
 
 
128 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1555  Ectoine synthase  45.74 
 
 
130 aa  107  8.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19660  L-ectoine synthase  43.85 
 
 
138 aa  106  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.942156  decreased coverage  0.00151851 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0334  L-ectoine synthase  46.28 
 
 
128 aa  101  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.981296 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5030  L-ectoine synthase  40.62 
 
 
128 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.192143  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02920  L-ectoine synthase  40.91 
 
 
137 aa  80.9  0.000000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1459  hypothetical protein  38.1 
 
 
332 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0434689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>