43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1028 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1028  L-ectoine synthase  100 
 
 		 133 aa  280  5.000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1191  L-ectoine synthase  73.85 
 
 		 132 aa  214  2.9999999999999998e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.600965 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02452  L-ectoine synthase  62.99 
 
 		 128 aa  175  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1160  L-ectoine synthase  62.2 
 
 		 129 aa  173  6e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.341721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003603  L-ectoine synthase  62.2 
 
 		 128 aa  172  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0411  L-ectoine synthase  61.42 
 
 		 138 aa  171  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478719  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3010  L-ectoine synthase  57.26 
 
 		 132 aa  166  9e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2951  L-ectoine synthase  54.74 
 
 		 137 aa  163  6.9999999999999995e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.748451 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0553  L-ectoine synthase  55.28 
 
 		 130 aa  156  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.988987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1344  L-ectoine synthase  54.69 
 
 		 128 aa  152  1e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0137023 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1878  L-ectoine synthase  56.35 
 
 		 130 aa  150  5.9999999999999996e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0095983  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2621  Ectoine synthase  54.96 
 
 		 142 aa  146  8e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.982438 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0960  L-ectoine synthase  53.49 
 
 		 129 aa  146  8e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.612167  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0616  L-ectoine synthase  54.87 
 
 		 131 aa  134  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1734  L-ectoine synthase  50.4 
 
 		 126 aa  134  5e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.528654  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4085  L-ectoine synthase  48.44 
 
 		 132 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24820  L-ectoine synthase  45.31 
 
 		 130 aa  133  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.383396  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0444  L-ectoine synthase  53.98 
 
 		 131 aa  132  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0079  L-ectoine synthase  54.87 
 
 		 131 aa  130  6e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0520  L-ectoine synthase  53.44 
 
 		 131 aa  130  6e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5214  Ectoine synthase  44.53 
 
 		 131 aa  130  9e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.285103 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5272  L-ectoine synthase  43.41 
 
 		 130 aa  129  9e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.733165 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0302  L-ectoine synthase  45.04 
 
 		 134 aa  129  9e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4451  L-ectoine synthase  48.06 
 
 		 132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34790  L-ectoine synthase  44.96 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.220713 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1190  L-ectoine synthase  54.78 
 
 		 132 aa  129  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192076 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5813  Ectoine synthase  45.93 
 
 		 139 aa  128  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2796  L-ectoine synthase  50 
 
 		 128 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3987  L-ectoine synthase  47.29 
 
 		 132 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.222162 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1555  Ectoine synthase  45.67 
 
 		 130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4834  L-ectoine synthase  43.41 
 
 		 130 aa  124  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1110  L-ectoine synthase  42.64 
 
 		 137 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0196  L-ectoine synthase  51.28 
 
 		 135 aa  123  7e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4192  L-ectoine synthase  43.55 
 
 		 129 aa  118  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.017142  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4258  L-ectoine synthase  43.55 
 
 		 129 aa  118  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0665619  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4419  L-ectoine synthase  43.55 
 
 		 132 aa  117  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.750905  normal  0.504417 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2064  Ectoine synthase  42.52 
 
 		 142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19660  L-ectoine synthase  40 
 
 		 138 aa  110  8.000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.942156  decreased coverage  0.00151851 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2638  L-ectoine synthase  45 
 
 		 128 aa  104  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.766502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5030  L-ectoine synthase  41.13 
 
 		 128 aa  99.4  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.192143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0334  L-ectoine synthase  42.5 
 
 		 128 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.981296 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0578  L-ectoine synthase  40.83 
 
 		 128 aa  96.3  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02920  L-ectoine synthase  39.82 
 
 		 137 aa  87  7e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>