44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0334 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_0334  L-ectoine synthase  100 
 
 		 128 aa  268  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.981296 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2638  L-ectoine synthase  74.22 
 
 		 128 aa  209  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.766502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5030  L-ectoine synthase  75 
 
 		 128 aa  209  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.192143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0578  L-ectoine synthase  72.66 
 
 		 128 aa  203  8e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02920  L-ectoine synthase  53.91 
 
 		 137 aa  136  7.999999999999999e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003603  L-ectoine synthase  42.15 
 
 		 128 aa  112  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02452  L-ectoine synthase  41.32 
 
 		 128 aa  110  8.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0960  L-ectoine synthase  47.2 
 
 		 129 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.612167  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0411  L-ectoine synthase  42.86 
 
 		 138 aa  107  7.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478719  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1734  L-ectoine synthase  43.8 
 
 		 126 aa  106  9.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.528654  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1191  L-ectoine synthase  43.33 
 
 		 132 aa  104  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.600965 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1110  L-ectoine synthase  46.77 
 
 		 137 aa  103  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0196  L-ectoine synthase  46.4 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1878  L-ectoine synthase  46.28 
 
 		 130 aa  101  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0095983  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2796  L-ectoine synthase  44.54 
 
 		 128 aa  100  9e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1160  L-ectoine synthase  48.36 
 
 		 129 aa  99.8  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.341721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0616  L-ectoine synthase  42.5 
 
 		 131 aa  99  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0444  L-ectoine synthase  42.5 
 
 		 131 aa  98.6  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1028  L-ectoine synthase  42.5 
 
 		 133 aa  97.8  5e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2951  L-ectoine synthase  43.33 
 
 		 137 aa  97.4  6e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.748451 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1190  L-ectoine synthase  44.17 
 
 		 132 aa  95.1  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192076 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1344  L-ectoine synthase  42.02 
 
 		 128 aa  95.1  3e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0137023 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0553  L-ectoine synthase  39.2 
 
 		 130 aa  93.6  8e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.988987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0079  L-ectoine synthase  42.5 
 
 		 131 aa  93.2  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3987  L-ectoine synthase  42.86 
 
 		 132 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.222162 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4451  L-ectoine synthase  42.86 
 
 		 132 aa  92.8  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2621  Ectoine synthase  40.16 
 
 		 142 aa  91.3  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.982438 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0520  L-ectoine synthase  43.65 
 
 		 131 aa  90.5  8e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4085  L-ectoine synthase  41.18 
 
 		 132 aa  90.1  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24820  L-ectoine synthase  39.34 
 
 		 130 aa  87.8  4e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.383396  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34790  L-ectoine synthase  36.89 
 
 		 129 aa  87.4  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.220713 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3010  L-ectoine synthase  36.07 
 
 		 132 aa  86.3  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0302  L-ectoine synthase  39.34 
 
 		 134 aa  85.9  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5214  Ectoine synthase  37.7 
 
 		 131 aa  84  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.285103 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5813  Ectoine synthase  42.99 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4419  L-ectoine synthase  35.83 
 
 		 132 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.750905  normal  0.504417 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4258  L-ectoine synthase  35.83 
 
 		 129 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0665619  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4192  L-ectoine synthase  35.83 
 
 		 129 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.017142  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2064  Ectoine synthase  33.87 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1555  Ectoine synthase  33.61 
 
 		 130 aa  74.3  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4834  L-ectoine synthase  34.17 
 
 		 130 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5272  L-ectoine synthase  32.81 
 
 		 130 aa  73.6  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.733165 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19660  L-ectoine synthase  33.61 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.942156  decreased coverage  0.00151851 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2847  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.21 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>