43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3987 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3987  L-ectoine synthase  100 
 
 		 132 aa  275  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.222162 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4451  L-ectoine synthase  97.73 
 
 		 132 aa  269  8.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4085  L-ectoine synthase  94.49 
 
 		 132 aa  249  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2796  L-ectoine synthase  74.4 
 
 		 128 aa  193  7e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0079  L-ectoine synthase  53.08 
 
 		 131 aa  150  5.9999999999999996e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2621  Ectoine synthase  52.67 
 
 		 142 aa  149  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.982438 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0553  L-ectoine synthase  51.52 
 
 		 130 aa  144  5e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.988987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1110  L-ectoine synthase  51.61 
 
 		 137 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0960  L-ectoine synthase  51.94 
 
 		 129 aa  141  3e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.612167  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1190  L-ectoine synthase  52.38 
 
 		 132 aa  139  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192076 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0616  L-ectoine synthase  50 
 
 		 131 aa  134  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0444  L-ectoine synthase  49.61 
 
 		 131 aa  133  6.0000000000000005e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1191  L-ectoine synthase  46.51 
 
 		 132 aa  131  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.600965 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1028  L-ectoine synthase  47.29 
 
 		 133 aa  127  4.0000000000000003e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24820  L-ectoine synthase  48.06 
 
 		 130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.383396  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0520  L-ectoine synthase  48.85 
 
 		 131 aa  124  3e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1878  L-ectoine synthase  48.03 
 
 		 130 aa  124  5e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0095983  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2951  L-ectoine synthase  47.58 
 
 		 137 aa  123  7e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.748451 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1160  L-ectoine synthase  43.75 
 
 		 129 aa  123  7e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.341721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02452  L-ectoine synthase  44.88 
 
 		 128 aa  123  7e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003603  L-ectoine synthase  44.09 
 
 		 128 aa  121  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0196  L-ectoine synthase  47.29 
 
 		 135 aa  120  6e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34790  L-ectoine synthase  42.64 
 
 		 129 aa  117  7e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.220713 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0411  L-ectoine synthase  42.06 
 
 		 138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478719  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0302  L-ectoine synthase  43.85 
 
 		 134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3010  L-ectoine synthase  41.13 
 
 		 132 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1734  L-ectoine synthase  42.86 
 
 		 126 aa  113  8.999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.528654  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5214  Ectoine synthase  40.15 
 
 		 131 aa  111  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.285103 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1344  L-ectoine synthase  43.08 
 
 		 128 aa  111  3e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0137023 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5813  Ectoine synthase  42.65 
 
 		 139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2064  Ectoine synthase  43.08 
 
 		 142 aa  109  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1555  Ectoine synthase  41.27 
 
 		 130 aa  103  8e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4419  L-ectoine synthase  40.16 
 
 		 132 aa  101  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.750905  normal  0.504417 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4192  L-ectoine synthase  39.37 
 
 		 129 aa  100  7e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.017142  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4258  L-ectoine synthase  39.37 
 
 		 129 aa  100  7e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0665619  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5272  L-ectoine synthase  40.15 
 
 		 130 aa  100  8e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.733165 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19660  L-ectoine synthase  40.48 
 
 		 138 aa  98.2  4e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.942156  decreased coverage  0.00151851 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5030  L-ectoine synthase  50.96 
 
 		 128 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.192143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4834  L-ectoine synthase  37.9 
 
 		 130 aa  94.4  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0334  L-ectoine synthase  42.86 
 
 		 128 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.981296 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02920  L-ectoine synthase  46.67 
 
 		 137 aa  91.3  4e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2638  L-ectoine synthase  43.7 
 
 		 128 aa  90.9  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.766502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0578  L-ectoine synthase  41.18 
 
 		 128 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>