125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1488 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1488  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 115 aa  235  2e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00804045  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1532  cupin 2 domain-containing protein  85.22 
 
 		 115 aa  209  7.999999999999999e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1305  cupin 2, barrel  42.98 
 
 		 115 aa  105  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0335072  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0973  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.59 
 
 		 118 aa  97.8  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0206  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.43 
 
 		 115 aa  96.7  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0788  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.27 
 
 		 114 aa  93.2  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2162  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.36 
 
 		 115 aa  92.4  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000761945  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1646  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.04 
 
 		 116 aa  69.7  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  34.83 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1603  cupin 2 domain-containing protein  32.43 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2973  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40.85 
 
 		 274 aa  54.3  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1009  cupin family protein  41.43 
 
 		 119 aa  53.5  0.0000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1904  cupin region  31.46 
 
 		 120 aa  53.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1579  TonB box-like  40 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1044  methionine--tRNA ligase  38.46 
 
 		 671 aa  52.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.120671 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1608  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.33 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00104789  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1757  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.1 
 
 		 125 aa  50.4  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.128793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2409  cupin family protein  32.05 
 
 		 114 aa  50.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116838  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  36.36 
 
 		 163 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003224  mannose-6-phosphate isomerase  26.8 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3273  methionyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 		 662 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.433163 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2414  hypothetical protein  43.1 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.478977  normal  0.947675 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30 
 
 		 128 aa  48.9  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.492542  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3146  cupin 2 domain-containing protein  31.94 
 
 		 134 aa  48.9  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10260  cupin domain-containing protein  34.12 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.227794 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.19 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5302  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.85 
 
 		 153 aa  48.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.78 
 
 		 117 aa  48.9  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.588155  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0134  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.89 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1662  cupin 2 domain-containing protein  32.81 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000140317  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0602  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.17 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2629  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.91 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0577  hypothetical protein  40.85 
 
 		 125 aa  47.8  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.116523  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3089  Methionine--tRNA ligase  36.92 
 
 		 749 aa  47.8  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.107488  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58380  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 187 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5113  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 187 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2819  MerR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 192 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.142376 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3140  mannose-6-phosphate isomerase, bifunctional enzyme  33.33 
 
 		 458 aa  47  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.116688  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0440  cupin 2, barrel  40 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.351298  normal  0.537185 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1270  hypothetical protein  34.21 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0544  hypothetical protein, putative phage gene  27.55 
 
 		 116 aa  47  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.597495  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8561  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.94 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853837  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1882  auxin-binding protein, putative  38.81 
 
 		 167 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0865  cupin 2 domain-containing protein  43.66 
 
 		 152 aa  46.2  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.151953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0842  cupin 2 domain-containing protein  31.94 
 
 		 188 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2228  cupin 2 domain-containing protein  36.51 
 
 		 166 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000300974 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1371  cupin 2 domain-containing protein  37.88 
 
 		 372 aa  45.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898845 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4399  polyketide synthesis domain protein  37.88 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4402  polyketide synthesis domain-containing protein  37.88 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.155389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4287  polyketide synthesis domain protein  37.88 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.640485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4317  polyketide synthesis domain protein  36.36 
 
 		 116 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4469  polyketide synthesis domain-containing protein  36.36 
 
 		 116 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1644  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.92 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.522674  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07738  hypothetical protein  39.34 
 
 		 173 aa  45.4  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2072  auxin-binding protein, putative  37.31 
 
 		 167 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0382674  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3712  cupin region  36.36 
 
 		 172 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.963003  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0625  hypothetical protein  34.92 
 
 		 166 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1827  hypothetical protein  30.77 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00420  cupin domain-containing protein  28.79 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.33037 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1633  cupin 2 domain-containing protein  29.52 
 
 		 113 aa  45.1  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0389  cupin 2 domain-containing protein  28.1 
 
 		 122 aa  45.1  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.8 
 
 		 192 aa  44.3  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2026  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.8 
 
 		 116 aa  43.9  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0456493  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0441  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.76 
 
 		 132 aa  43.9  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0909  hypothetical protein  31.03 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0993672  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3018  cupin domain-containing protein  37.5 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.117139  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2908  hypothetical protein  38.46 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  29.87 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0950  cupin 2 domain-containing protein  38.57 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5234  cupin 2 domain-containing protein  35.62 
 
 		 172 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0933989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2775  cupin 2 domain-containing protein  37.5 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.108544  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.94 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.754668  normal  0.233584 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6318  Methionine--tRNA ligase  33.85 
 
 		 662 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.955979 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2982  polyketide synthesis domain protein  37.5 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2260  polyketide synthesis domain protein  37.5 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0666056 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2699  hypothetical protein  33.8 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.615203  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1444  cupin 2 domain-containing protein  31.34 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4778  cupin 2 domain-containing protein  35.38 
 
 		 350 aa  42  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.168461 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1023  cupin 2 domain-containing protein  25.74 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0722  bicupin, oxalate decarboxylase family  31.19 
 
 		 234 aa  42.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.85 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2770  cupin domain-containing protein  35.94 
 
 		 120 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2719  hypothetical protein  35.94 
 
 		 120 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4136  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.51 
 
 		 127 aa  41.6  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2981  cupin domain-containing protein  35.94 
 
 		 120 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1285  cupin region  33.75 
 
 		 113 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4274  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.11 
 
 		 150 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.680617 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1468  cupin 2 domain-containing protein  34.78 
 
 		 190 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2161  cupin 2 domain-containing protein  35.71 
 
 		 152 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0191913  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1525  oxalate decarboxylase  30.51 
 
 		 408 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0264195 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1277  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.14 
 
 		 167 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0247695  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2978  polyketide synthesis domain protein  35.94 
 
 		 120 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000628046 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0906  cupin region  28.57 
 
 		 142 aa  41.2  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.168616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3039  cupin 2, barrel  30.86 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0762499  normal  0.519853 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4820  cupin 2, barrel  36.92 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3346  cupin 2 domain-containing protein  36.92 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4169  cupin 2 domain-containing protein  36.92 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0485  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 197 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000244144  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1188  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.14 
 
 		 172 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.814089  normal  0.762073 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>