21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0909 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0909  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  256  5.0000000000000005e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0993672  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0831  hypothetical protein  50 
 
 		 130 aa  105  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.668197  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0375  hypothetical protein  51.89 
 
 		 124 aa  98.6  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12971  hypothetical protein  31.75 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.298883  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13041  hypothetical protein  31.75 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10991  double-stranded beta-helix domain-containing protein  42.47 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1225  hypothetical protein  31.34 
 
 		 140 aa  51.6  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1204  hypothetical protein  28.44 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.259392  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3656  cupin 2, barrel  31.85 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.110053  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13891  hypothetical protein  37.84 
 
 		 143 aa  47  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0594  hypothetical protein  37.84 
 
 		 143 aa  47  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0819  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 123 aa  46.2  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0623  cupin 2 domain-containing protein  31.11 
 
 		 148 aa  43.9  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.339889  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2440  hypothetical protein  30.56 
 
 		 129 aa  43.9  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542121  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1488  cupin 2 domain-containing protein  31.03 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00804045  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1532  cupin 2 domain-containing protein  34.33 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1491  cupin:protein of unknown function DUF861  31.15 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3496  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.41 
 
 		 140 aa  40.8  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04261  hypothetical protein  32.88 
 
 		 142 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.648244  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2380  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.35 
 
 		 231 aa  40.4  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2490  hypothetical protein  22.94 
 
 		 132 aa  40  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.440666  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>