35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0441 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0441  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 132 aa  271  3e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0545  Cupin 2 conserved barrel domain protein  68.7 
 
 		 131 aa  198  1.9999999999999998e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0851  mate efflux family protein  54.33 
 
 		 124 aa  134  6.0000000000000005e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0817404  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0121  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.68 
 
 		 141 aa  130  7.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0997  cupin 2 domain-containing protein  41.46 
 
 		 137 aa  113  1.0000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138878 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2394  cupin 2 domain-containing protein  36.69 
 
 		 151 aa  104  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00264239  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  36.49 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1607  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36 
 
 		 158 aa  48.1  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.978873  normal  0.178437 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5434  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.81 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.429783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2161  cupin 2 domain-containing protein  32.47 
 
 		 152 aa  47.4  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0191913  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1644  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44 
 
 		 154 aa  47  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.522674  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5139  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.94 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3712  cupin region  26.97 
 
 		 172 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.963003  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3161  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.66 
 
 		 158 aa  44.3  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1488  cupin 2 domain-containing protein  36.76 
 
 		 115 aa  43.9  0.0008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00804045  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2228  cupin 2 domain-containing protein  31.65 
 
 		 166 aa  43.5  0.0009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000300974 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.57 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0912  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.51 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  26.73 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2945  cupin 2 domain-containing protein  26.14 
 
 		 171 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3184  cupin region  28.95 
 
 		 162 aa  42.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0568  cupin 2 domain-containing protein  32 
 
 		 172 aa  42  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1532  cupin 2 domain-containing protein  28.09 
 
 		 115 aa  41.6  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1917  hypothetical protein  32 
 
 		 172 aa  41.2  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1904  cupin region  28.12 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3001  cupin 2 domain-containing protein  36.54 
 
 		 124 aa  41.2  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4418  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.71 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  34.38 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2629  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.34 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0698  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.47 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.793931  normal  0.732081 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0814  cupin 2 protein  32.89 
 
 		 173 aa  41.2  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2847  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40 
 
 		 119 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2072  auxin-binding protein, putative  44.9 
 
 		 167 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0382674  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0680  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.58 
 
 		 106 aa  40  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00734165  normal  0.352119 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003224  mannose-6-phosphate isomerase  32.35 
 
 		 116 aa  40  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>