116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1188 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1188  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 172 aa  357  6e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.814089  normal  0.762073 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1277  Cupin 2 conserved barrel domain protein  85.47 
 
 		 167 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0247695  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2265  cupin 2 domain-containing protein  44.51 
 
 		 172 aa  143  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.97009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2945  cupin 2 domain-containing protein  40.94 
 
 		 171 aa  139  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3712  cupin region  41.04 
 
 		 172 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.963003  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1882  auxin-binding protein, putative  44.44 
 
 		 167 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1315  cupin 2 domain-containing protein  39.64 
 
 		 163 aa  130  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00314344  normal  0.472915 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1458  cupin 2 domain-containing protein  42.33 
 
 		 174 aa  130  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3184  cupin region  41.46 
 
 		 162 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2072  auxin-binding protein, putative  43.35 
 
 		 167 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0382674  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2228  cupin 2 domain-containing protein  42.17 
 
 		 166 aa  128  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000300974 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0568  cupin 2 domain-containing protein  41.98 
 
 		 172 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1917  hypothetical protein  41.36 
 
 		 172 aa  125  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0814  cupin 2 protein  40.36 
 
 		 173 aa  119  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0971  cupin domain-containing protein  38.93 
 
 		 171 aa  92  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.341283  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1033  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.93 
 
 		 172 aa  90.9  9e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.714129  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1030  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.17 
 
 		 172 aa  89  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1474  hypothetical protein  37.06 
 
 		 154 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.208655  normal  0.292696 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1696  cupin 2 protein  39.29 
 
 		 161 aa  79.7  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1468  cupin 2 domain-containing protein  38.89 
 
 		 190 aa  78.2  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2431  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.61 
 
 		 161 aa  75.9  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00370098  hitchhiker  0.00000777225 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2805  hypothetical protein  36.61 
 
 		 161 aa  75.9  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.523774  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2765  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.71 
 
 		 161 aa  75.1  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.178075 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3169  hypothetical protein  35.71 
 
 		 161 aa  75.1  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1644  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.54 
 
 		 154 aa  73.9  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.522674  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2502  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.91 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.529336 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.91 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2672  hypothetical protein  33.91 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.311364  normal  0.391613 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1371  cupin 2 domain-containing protein  29.48 
 
 		 372 aa  71.2  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898845 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1110  cupin 2, barrel  33.94 
 
 		 170 aa  70.9  0.000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3626  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.04 
 
 		 159 aa  70.5  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2908  hypothetical protein  41.58 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0971  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.88 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3161  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.76 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5234  cupin 2 domain-containing protein  37.5 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0933989  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1607  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.23 
 
 		 158 aa  67.8  0.00000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.978873  normal  0.178437 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4820  cupin 2, barrel  39.6 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3346  cupin 2 domain-containing protein  39.6 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2161  cupin 2 domain-containing protein  31.47 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0191913  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4169  cupin 2 domain-containing protein  39.6 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5131  cupin 2 domain-containing protein  38.61 
 
 		 155 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.720465  normal  0.658143 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0435  cupin domain-containing protein  35.35 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2010  cupin domain-containing protein  35.35 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1917  cupin domain-containing protein  35.35 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3249  cupin 2 domain-containing protein  28.68 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3273  cupin 2 domain-containing protein  37.14 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0580  hypothetical protein  35.35 
 
 		 160 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0950  cupin 2 domain-containing protein  26.92 
 
 		 158 aa  62  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1331  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.1 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1011  hypothetical protein  34.19 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0848  cupin 2 domain-containing protein  26.72 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0801  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.78 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0602591  normal  0.755419 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0887  hypothetical protein  34.34 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1854  hypothetical protein  34.34 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3440  cupin 2 domain-containing protein  26.92 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1459  hypothetical protein  32.73 
 
 		 332 aa  57.8  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0434689  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.88 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.1 
 
 		 181 aa  53.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2394  cupin 2 domain-containing protein  31.82 
 
 		 151 aa  52.8  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00264239  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0304  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.29 
 
 		 156 aa  52  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000378551  normal  0.964061 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5493  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.29 
 
 		 160 aa  52  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302326  normal  0.111821 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0551  cupin 2 domain-containing protein  24.11 
 
 		 170 aa  51.2  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.201828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3273  methionyl-tRNA synthetase  28.26 
 
 		 662 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.433163 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4703  cupin 2 domain-containing protein  33 
 
 		 154 aa  50.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.835831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.92 
 
 		 332 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.83 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0950  cupin 2 domain-containing protein  28 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0865  cupin 2 domain-containing protein  24 
 
 		 152 aa  48.9  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.151953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3503  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.35 
 
 		 182 aa  48.1  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02768  cupin region  25.62 
 
 		 129 aa  48.1  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.711044  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1001  hypothetical protein  30.84 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4857  cupin domain-containing protein  28.87 
 
 		 157 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0286871 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0866  cupin 2 domain-containing protein  37.27 
 
 		 333 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.647462  normal  0.208586 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0751  cupin 2 domain-containing protein  26.47 
 
 		 159 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.204167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2629  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.13 
 
 		 138 aa  46.6  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0967  hypothetical protein  26.67 
 
 		 153 aa  45.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.410205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4760  mannose-6-phosphate isomerase, type II  29.91 
 
 		 148 aa  45.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0517345 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13508  hypothetical protein  31.25 
 
 		 177 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0441  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.04 
 
 		 132 aa  45.4  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3086  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.25 
 
 		 159 aa  44.7  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.097702  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.24 
 
 		 146 aa  44.7  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2355  hypothetical protein  25.25 
 
 		 161 aa  44.7  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4126  cupin 2 domain-containing protein  38.03 
 
 		 119 aa  44.3  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.5 
 
 		 166 aa  44.3  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2936  cupin 2 protein  29.66 
 
 		 151 aa  43.9  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0225077  hitchhiker  0.00286289 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  39.44 
 
 		 163 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7188  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.68 
 
 		 152 aa  43.9  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2981  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.25 
 
 		 159 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2964  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.69 
 
 		 160 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  37.29 
 
 		 137 aa  44.3  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.03 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2501  hypothetical protein  24.24 
 
 		 161 aa  43.1  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2894  cupin 2 domain-containing protein  29.25 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  34.12 
 
 		 150 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0223  cupin 2 domain-containing protein  38.71 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0134  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.24 
 
 		 118 aa  43.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2075  cupin region  48.08 
 
 		 135 aa  42.4  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.626152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0747  cupin-like protein  27.48 
 
 		 169 aa  42.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179804  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND04560  expressed protein  35.23 
 
 		 177 aa  42  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3060  cupin 2 domain-containing protein  27.82 
 
 		 149 aa  42  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00975792 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>