62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2026 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2026  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 116 aa  236  1e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0456493  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1386  cupin 2 domain-containing protein  59.48 
 
 		 116 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1397  cupin 2 domain-containing protein  53.45 
 
 		 115 aa  130  6.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0319163  normal  0.27943 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0389  cupin 2 domain-containing protein  44.66 
 
 		 122 aa  106  9.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1036  cupin 2 domain-containing protein  47.78 
 
 		 104 aa  90.1  8e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.276855  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1633  cupin 2 domain-containing protein  42.7 
 
 		 113 aa  81.6  0.000000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2600  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.556264 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1335  cupin 2 domain-containing protein  43.75 
 
 		 114 aa  77.8  0.00000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000568302  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1351  cupin 2 domain-containing protein  43.75 
 
 		 114 aa  77.8  0.00000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00886277  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.05 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.438384  normal  0.13585 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0303  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1595  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.38 
 
 		 123 aa  67.8  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.040843 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0602  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.56 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2121  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.27 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.625862  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0432  cupin region  29.9 
 
 		 117 aa  62.4  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.583729  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1603  cupin 2 domain-containing protein  33.71 
 
 		 123 aa  60.5  0.000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3226  hypothetical protein  41.25 
 
 		 167 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2200  hypothetical protein  39.19 
 
 		 163 aa  49.7  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.192403 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5804  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.86 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1373  ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit  31.33 
 
 		 551 aa  50.1  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2400  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.38 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2234  cupin 2, barrel  32.14 
 
 		 159 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.328045 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0440  cupin 2, barrel  34.25 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.351298  normal  0.537185 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5302  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.74 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0819  cupin 2 domain-containing protein  27.47 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1579  TonB box-like  36 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.75 
 
 		 128 aa  47.4  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.492542  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2000  hypothetical protein  35.62 
 
 		 156 aa  47.8  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2183  cupin 2, barrel  36.56 
 
 		 166 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0487258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1167  cupin 2 domain-containing protein  27.17 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168838 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2463  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.84 
 
 		 165 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0556151  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1883  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31 
 
 		 157 aa  44.3  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0347  Mannose-1-phosphate guanylyltransferase  35.29 
 
 		 476 aa  44.3  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0323  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.87 
 
 		 151 aa  43.9  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1488  cupin 2 domain-containing protein  33.8 
 
 		 115 aa  43.9  0.0008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00804045  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1358  cupin 2 domain-containing protein  24.32 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.660301  normal  0.0940885 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1159  putative transcription regulator protein  37.31 
 
 		 182 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3140  mannose-6-phosphate isomerase, bifunctional enzyme  43.64 
 
 		 458 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.116688  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1532  cupin 2 domain-containing protein  36.62 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2847  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.43 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1882  auxin-binding protein, putative  33.77 
 
 		 167 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0847  cupin 2 domain-containing protein  30.85 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1023  cupin 2 domain-containing protein  23.29 
 
 		 120 aa  42  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0901  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  35.71 
 
 		 151 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.554615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0104  cupin  32.43 
 
 		 122 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.300673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0615  hypothetical protein  35.29 
 
 		 161 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2932  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.97 
 
 		 121 aa  41.6  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2072  auxin-binding protein, putative  33.77 
 
 		 167 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0382674  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3712  cupin region  31.91 
 
 		 172 aa  41.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.963003  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2249  cupin 2, barrel  25.23 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.72 
 
 		 181 aa  41.2  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  32.05 
 
 		 150 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1607  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.38 
 
 		 158 aa  41.2  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.978873  normal  0.178437 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1305  cupin 2, barrel  30 
 
 		 115 aa  40.8  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0335072  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0540  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.24 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07738  hypothetical protein  25.24 
 
 		 173 aa  40.8  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2100  cupin region  33.85 
 
 		 119 aa  40.8  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2037  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.13 
 
 		 112 aa  40.4  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0486792  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13508  hypothetical protein  34.04 
 
 		 177 aa  40.4  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8561  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.51 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853837  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2053  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.45 
 
 		 118 aa  40.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2162  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.41 
 
 		 115 aa  40.4  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000761945  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>