32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2200 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2200  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  331  3e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.192403 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1579  TonB box-like  55.48 
 
 		 151 aa  167  6e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5302  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50 
 
 		 153 aa  158  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0440  cupin 2, barrel  49.28 
 
 		 149 aa  144  7.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.351298  normal  0.537185 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1270  hypothetical protein  47.2 
 
 		 140 aa  115  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17330  cupin domain-containing protein  37.1 
 
 		 148 aa  85.1  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.017863  normal  0.0817952 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2026  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.19 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0456493  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1459  hypothetical protein  41.07 
 
 		 332 aa  48.5  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0434689  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3189  cupin 2, barrel  34.65 
 
 		 190 aa  47.8  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000805068  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3791  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.89 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302037  normal  0.0222415 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.5 
 
 		 332 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1285  cupin region  39.68 
 
 		 113 aa  45.8  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3997  cupin 2 domain-containing protein  32.39 
 
 		 148 aa  45.8  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.439431  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1654  hypothetical protein  29.87 
 
 		 134 aa  45.1  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.225443  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.68 
 
 		 103 aa  44.3  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.754668  normal  0.233584 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  40.74 
 
 		 150 aa  44.3  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0320  cupin 2 domain-containing protein  29.41 
 
 		 146 aa  43.9  0.0009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.864661  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0912  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 125 aa  43.9  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.25 
 
 		 192 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4180  hypothetical protein  32.76 
 
 		 246 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.745034 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1994  cupin 2 domain-containing protein  30.88 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.663759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1044  methionine--tRNA ligase  29.81 
 
 		 671 aa  42.4  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.120671 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3622  hypothetical protein  32.76 
 
 		 247 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6092  AraC family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 310 aa  42  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.391074  normal  0.394917 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  33.78 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2685  hypothetical protein  24.63 
 
 		 152 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.273941  normal  0.254874 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1662  cupin 2 domain-containing protein  30 
 
 		 108 aa  41.6  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000140317  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8561  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.78 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853837  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.93 
 
 		 128 aa  41.2  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.492542  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3405  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35 
 
 		 156 aa  41.2  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2672  hypothetical protein  31.71 
 
 		 159 aa  40.8  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.311364  normal  0.391613 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  30.95 
 
 		 163 aa  40.8  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>