18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3226 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3226  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  347  6e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2234  cupin 2, barrel  83.65 
 
 		 159 aa  276  8e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.328045 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2463  Cupin 2 conserved barrel domain protein  74.85 
 
 		 165 aa  248  3e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0556151  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2183  cupin 2, barrel  72.67 
 
 		 166 aa  235  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0487258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0901  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  60 
 
 		 151 aa  181  5.0000000000000004e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.554615  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0323  Cupin 2 conserved barrel domain protein  60 
 
 		 151 aa  180  7e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1243  Cupin 2 conserved barrel domain protein  59.09 
 
 		 161 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.942705 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2000  hypothetical protein  61.19 
 
 		 156 aa  168  3e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1883  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.99 
 
 		 157 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1167  cupin 2 domain-containing protein  43.17 
 
 		 152 aa  122  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168838 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0468  cupin 2 domain-containing protein  44.29 
 
 		 157 aa  111  6e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1373  ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit  37.9 
 
 		 551 aa  88.2  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_88029  predicted protein  39.32 
 
 		 741 aa  65.1  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0692998 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0389  cupin 2 domain-containing protein  31.62 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2026  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.25 
 
 		 116 aa  52.4  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0456493  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0819  cupin 2 domain-containing protein  31.71 
 
 		 123 aa  47  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1397  cupin 2 domain-containing protein  30 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0319163  normal  0.27943 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0134  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.1 
 
 		 118 aa  40.8  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>