21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1243 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1243  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 161 aa  326  7e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.942705 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0323  Cupin 2 conserved barrel domain protein  56.85 
 
 		 151 aa  182  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2000  hypothetical protein  59.35 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0901  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  53.59 
 
 		 151 aa  176  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.554615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2234  cupin 2, barrel  61.97 
 
 		 159 aa  175  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.328045 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3226  hypothetical protein  59.09 
 
 		 167 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2463  Cupin 2 conserved barrel domain protein  57.53 
 
 		 165 aa  169  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0556151  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2183  cupin 2, barrel  54 
 
 		 166 aa  158  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0487258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1167  cupin 2 domain-containing protein  52.21 
 
 		 152 aa  139  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168838 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1883  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.21 
 
 		 157 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0468  cupin 2 domain-containing protein  48.91 
 
 		 157 aa  120  7e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1373  ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit  37.9 
 
 		 551 aa  90.5  8e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_88029  predicted protein  41.86 
 
 		 741 aa  70.1  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0692998 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0432  cupin region  33.75 
 
 		 117 aa  46.6  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.583729  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0602  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.99 
 
 		 118 aa  44.7  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0389  cupin 2 domain-containing protein  25.97 
 
 		 122 aa  44.7  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2629  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.33 
 
 		 138 aa  43.9  0.0009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1335  cupin 2 domain-containing protein  27.72 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000568302  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1351  cupin 2 domain-containing protein  27.72 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00886277  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0895  cupin 2 domain-containing protein  28.42 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  32.86 
 
 		 137 aa  41.2  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>