45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1167 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1167  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 
152 aa  310  3.9999999999999997e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.168838 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0468  cupin 2 domain-containing protein  54.3 
 
 
157 aa  174  3e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0901  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  49.31 
 
 
151 aa  149  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.554615  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1883  Cupin 2 conserved barrel domain protein  49.67 
 
 
157 aa  146  8e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0323  Cupin 2 conserved barrel domain protein  51.05 
 
 
151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1243  Cupin 2 conserved barrel domain protein  52.21 
 
 
161 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.942705 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2000  hypothetical protein  48.85 
 
 
156 aa  131  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2183  cupin 2, barrel  49.61 
 
 
166 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0487258  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2234  cupin 2, barrel  45 
 
 
159 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.328045 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3226  hypothetical protein  43.17 
 
 
167 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2463  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.29 
 
 
165 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0556151  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1373  ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit  44.63 
 
 
551 aa  105  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_88029  predicted protein  42.86 
 
 
741 aa  91.3  5e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0692998 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0819  cupin 2 domain-containing protein  26.05 
 
 
123 aa  54.3  0.0000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0389  cupin 2 domain-containing protein  26.53 
 
 
122 aa  53.9  0.0000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.85 
 
 
122 aa  52.4  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.438384  normal  0.13585 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0602  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.43 
 
 
118 aa  51.2  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2629  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.24 
 
 
138 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2847  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.34 
 
 
119 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0104  cupin  33.33 
 
 
122 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.300673  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1036  cupin 2 domain-containing protein  25.81 
 
 
104 aa  50.1  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.276855  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1386  cupin 2 domain-containing protein  28.16 
 
 
116 aa  48.9  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0432  cupin region  29.29 
 
 
117 aa  48.9  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.583729  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1023  cupin 2 domain-containing protein  28.89 
 
 
120 aa  48.9  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2026  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.17 
 
 
116 aa  46.6  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0456493  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0895  cupin 2 domain-containing protein  30.08 
 
 
125 aa  46.2  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1397  cupin 2 domain-containing protein  28.57 
 
 
115 aa  45.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0319163  normal  0.27943 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2400  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.21 
 
 
127 aa  45.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0134  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.46 
 
 
118 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1927  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  27.4 
 
 
477 aa  45.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.328614  normal  0.35544 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3273  methionyl-tRNA synthetase  30.86 
 
 
662 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.433163 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1819  hypothetical protein  31.94 
 
 
114 aa  44.3  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8561  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.7 
 
 
140 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853837  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  35.29 
 
 
137 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2420  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.79 
 
 
284 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00497597 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1633  cupin 2 domain-containing protein  25 
 
 
113 aa  42.7  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1041  cupin 2 domain-containing protein  27.78 
 
 
311 aa  42.7  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421449  normal  0.0580221 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0445  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.85 
 
 
123 aa  42  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.205887 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1351  cupin 2 domain-containing protein  23.16 
 
 
114 aa  42  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00886277  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0790  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  26.47 
 
 
477 aa  42  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.916465  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0685  mannose-1-phosphate guanylyltransferase  26.47 
 
 
477 aa  42  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1335  cupin 2 domain-containing protein  23.16 
 
 
114 aa  42  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000568302  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1603  cupin 2 domain-containing protein  25.35 
 
 
123 aa  41.6  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0452  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.67 
 
 
136 aa  41.2  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5701  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.61 
 
 
261 aa  40.4  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0787064  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>