23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1819 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1819  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  236  6.999999999999999e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1947  hypothetical protein  28.16 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0281  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.18 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2661  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.84 
 
 		 122 aa  51.2  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0570  methionine--tRNA ligase  29.87 
 
 		 659 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.755013 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2847  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.77 
 
 		 119 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1009  cupin family protein  32.81 
 
 		 119 aa  44.7  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5005  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 255 aa  45.1  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158315  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4528  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 173 aa  44.7  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4562  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 173 aa  44.3  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1167  cupin 2 domain-containing protein  31.94 
 
 		 152 aa  44.3  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168838 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2150  cupin 2 domain-containing protein  33.77 
 
 		 124 aa  44.3  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0837605 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2247  transcriptional regulator, XRE family  31.67 
 
 		 190 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4533  transcriptional regulator, XRE family  31.67 
 
 		 173 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1373  ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit  26 
 
 		 551 aa  40.8  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1044  methionine--tRNA ligase  30.43 
 
 		 671 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.120671 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0134  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.38 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2328  cupin region  27.55 
 
 		 167 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.408411  normal  0.388933 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1603  cupin 2 domain-containing protein  25.64 
 
 		 123 aa  40.4  0.008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.51 
 
 		 189 aa  40.4  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0722  bicupin, oxalate decarboxylase family  28.07 
 
 		 234 aa  40.4  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.43 
 
 		 103 aa  40  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.754668  normal  0.233584 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05332  AraC-like ligand binding domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14370)  25.58 
 
 		 203 aa  40  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.484672  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>