77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2150 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2150  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 124 aa  258  1e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0837605 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2661  Cupin 2 conserved barrel domain protein  58.47 
 
 		 122 aa  157  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3623  Cupin 2 conserved barrel domain protein  56.9 
 
 		 122 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2965  hypothetical protein  41.58 
 
 		 130 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0208057  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2750  hypothetical protein  38.89 
 
 		 130 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0226239  hitchhiker  0.00875229 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3661  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.94 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03110  hypothetical protein  34.21 
 
 		 133 aa  77.4  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.050196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0570  methionine--tRNA ligase  37.76 
 
 		 659 aa  64.3  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.755013 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4208  Methionine--tRNA ligase  28.04 
 
 		 645 aa  54.7  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0857223  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3273  methionyl-tRNA synthetase  36.62 
 
 		 662 aa  50.8  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.433163 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1947  hypothetical protein  26.92 
 
 		 116 aa  50.4  0.000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1523  mannose-6-phosphate isomerase type II  37.5 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1496  mannose-6-phosphate isomerase type II  37.5 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1044  methionine--tRNA ligase  32.86 
 
 		 671 aa  47.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.120671 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6318  Methionine--tRNA ligase  31.43 
 
 		 662 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.955979 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1373  ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit  31.94 
 
 		 551 aa  46.2  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0389  cupin 2 domain-containing protein  31.19 
 
 		 122 aa  45.4  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1816  cupin 2 domain-containing protein  29.76 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.337557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3281  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  35.53 
 
 		 476 aa  44.7  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1329  mannose-6-phosphate isomerase  28 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0501  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1819  hypothetical protein  33.77 
 
 		 114 aa  44.3  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2228  cupin 2 domain-containing protein  29.63 
 
 		 166 aa  44.3  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000300974 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4274  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.88 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.680617 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1371  cupin 2 domain-containing protein  29.52 
 
 		 372 aa  43.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898845 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3293  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  32.89 
 
 		 479 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.448941  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1192  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  40.35 
 
 		 470 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.439492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2642  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  40.35 
 
 		 470 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.142665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2891  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  32.89 
 
 		 479 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.232299 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2906  hypothetical protein  24.27 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.808157  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5186  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  32.98 
 
 		 478 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0136961 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1366  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  32.89 
 
 		 480 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1709  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  46.67 
 
 		 272 aa  42.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3089  Methionine--tRNA ligase  31.43 
 
 		 749 aa  42.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.107488  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1314  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  32.5 
 
 		 476 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.79469  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2414  hypothetical protein  28.79 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.478977  normal  0.947675 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3325  mannose-6-phosphate isomerase type II  32.53 
 
 		 133 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17330  cupin domain-containing protein  40 
 
 		 148 aa  41.6  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.017863  normal  0.0817952 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1268  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  32.89 
 
 		 472 aa  42  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.157866 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20571  mannose-1-phosphate guanylyltransferase  26.74 
 
 		 485 aa  41.6  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0837  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  39.13 
 
 		 287 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126222 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0850  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  27.72 
 
 		 477 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3654  putative transcriptional regulator  33.77 
 
 		 274 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232111  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1927  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  30.88 
 
 		 477 aa  41.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.328614  normal  0.35544 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003224  mannose-6-phosphate isomerase  26.92 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0790  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  29.11 
 
 		 477 aa  40.8  0.006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.916465  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1358  cupin 2 domain-containing protein  27.36 
 
 		 119 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.660301  normal  0.0940885 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4180  hypothetical protein  31.34 
 
 		 246 aa  40.8  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.745034 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0544  hypothetical protein, putative phage gene  24.36 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.597495  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0685  mannose-1-phosphate guanylyltransferase  29.11 
 
 		 477 aa  40.8  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43580  putative transcriptional regulator  32.47 
 
 		 274 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.417491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1182  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  26.74 
 
 		 485 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.342611  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0413  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  31.75 
 
 		 480 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2020  cupin 2, barrel  36.36 
 
 		 155 aa  40.4  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434776 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1532  cupin 2 domain-containing protein  32.81 
 
 		 115 aa  40.8  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2188  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  30.14 
 
 		 475 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01704  DNA-binding transcriptional dual regulator  32.1 
 
 		 280 aa  40.4  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.906027  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0518  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  30.14 
 
 		 475 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2310  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  30.14 
 
 		 475 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132278  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1897  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  42.22 
 
 		 279 aa  40.4  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.737431  normal  0.387468 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0834  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  29.55 
 
 		 484 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.855143  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1907  transcriptional regulator, AraC family  42.22 
 
 		 279 aa  40.4  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00680023  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1081  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  30.14 
 
 		 475 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01692  hypothetical protein  32.1 
 
 		 280 aa  40.4  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2491  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  29.55 
 
 		 484 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.303599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1456  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  42.22 
 
 		 279 aa  40.4  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.276942 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1956  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  42.22 
 
 		 279 aa  40.4  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1817  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  42.22 
 
 		 279 aa  40.4  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.208317  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2453  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  42.22 
 
 		 279 aa  40.4  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1412  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  40 
 
 		 280 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.212987  normal  0.035912 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1429  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  40 
 
 		 280 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.670453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1444  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  40 
 
 		 280 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2729  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  28.77 
 
 		 481 aa  40  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.213311 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2029  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  40 
 
 		 280 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3622  hypothetical protein  31.34 
 
 		 247 aa  40.4  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1856  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  40 
 
 		 280 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.348031  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6330  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  30.85 
 
 		 479 aa  40  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4096  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.41 
 
 		 475 aa  40  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.286853 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>