29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2750 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2750  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  276  7e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0226239  hitchhiker  0.00875229 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2965  hypothetical protein  92.31 
 
 		 130 aa  256  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0208057  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3623  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.24 
 
 		 122 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2661  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.03 
 
 		 122 aa  106  9.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03110  hypothetical protein  42.11 
 
 		 133 aa  99.8  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.050196  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3661  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.74 
 
 		 218 aa  94  6e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2150  cupin 2 domain-containing protein  38.89 
 
 		 124 aa  88.2  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0837605 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4208  Methionine--tRNA ligase  28.57 
 
 		 645 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0857223  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1628  cupin 2, barrel  29.49 
 
 		 356 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1654  cupin 2 domain-containing protein  29.49 
 
 		 361 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0468  cupin 2 domain-containing protein  28.21 
 
 		 361 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1601  cupin 2 domain-containing protein  28.21 
 
 		 361 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0589  cupin 2 domain-containing protein  28.21 
 
 		 361 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0677  cupin 2 domain-containing protein  28.21 
 
 		 255 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3089  Methionine--tRNA ligase  26.5 
 
 		 749 aa  43.5  0.0009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.107488  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1707  Cupin domain protein  23.44 
 
 		 178 aa  40.8  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1044  methionine--tRNA ligase  28.17 
 
 		 671 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.120671 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4204  cupin 2 domain-containing protein  28.81 
 
 		 370 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469999  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2699  hypothetical protein  26.32 
 
 		 120 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.615203  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3270  gentisate 1,2-dioxygenase  30.56 
 
 		 342 aa  40.4  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.395363 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2978  polyketide synthesis domain protein  29.23 
 
 		 120 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000628046 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2981  cupin domain-containing protein  29.23 
 
 		 120 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2770  cupin domain-containing protein  29.23 
 
 		 120 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2719  hypothetical protein  29.23 
 
 		 120 aa  40.4  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2775  cupin 2 domain-containing protein  29.23 
 
 		 120 aa  40  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.108544  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3020  polyketide synthesis domain protein  29.23 
 
 		 120 aa  40  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2982  polyketide synthesis domain protein  29.23 
 
 		 120 aa  40  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2260  polyketide synthesis domain protein  29.23 
 
 		 120 aa  40  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0666056 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3018  cupin domain-containing protein  29.23 
 
 		 120 aa  40  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.117139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>