19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2965 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2965  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  275  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0208057  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2750  hypothetical protein  92.31 
 
 		 130 aa  256  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0226239  hitchhiker  0.00875229 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3623  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.55 
 
 		 122 aa  110  6e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2661  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.03 
 
 		 122 aa  106  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03110  hypothetical protein  43.86 
 
 		 133 aa  103  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.050196  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3661  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.64 
 
 		 218 aa  98.2  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2150  cupin 2 domain-containing protein  41.58 
 
 		 124 aa  89.4  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0837605 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4208  Methionine--tRNA ligase  28.57 
 
 		 645 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0857223  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3089  Methionine--tRNA ligase  27.87 
 
 		 749 aa  43.9  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.107488  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1654  cupin 2 domain-containing protein  25.25 
 
 		 361 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1628  cupin 2, barrel  25.25 
 
 		 356 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1044  methionine--tRNA ligase  29.58 
 
 		 671 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.120671 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0468  cupin 2 domain-containing protein  24.24 
 
 		 361 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1601  cupin 2 domain-containing protein  24.24 
 
 		 361 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0589  cupin 2 domain-containing protein  24.24 
 
 		 361 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0677  cupin 2 domain-containing protein  24.24 
 
 		 255 aa  41.6  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0544  hypothetical protein, putative phage gene  26.92 
 
 		 116 aa  41.2  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.597495  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1707  Cupin domain protein  23.44 
 
 		 178 aa  40.8  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5804  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.57 
 
 		 123 aa  40.4  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>