22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2661 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2661  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 122 aa  256  7e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2150  cupin 2 domain-containing protein  58.47 
 
 		 124 aa  157  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0837605 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3623  Cupin 2 conserved barrel domain protein  54.55 
 
 		 122 aa  144  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2750  hypothetical protein  41.03 
 
 		 130 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0226239  hitchhiker  0.00875229 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2965  hypothetical protein  41.03 
 
 		 130 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0208057  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03110  hypothetical protein  33.33 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.050196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0570  methionine--tRNA ligase  34.12 
 
 		 659 aa  64.7  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.755013 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3661  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.91 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4208  Methionine--tRNA ligase  26.17 
 
 		 645 aa  53.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0857223  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1819  hypothetical protein  36.84 
 
 		 114 aa  51.2  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3273  methionyl-tRNA synthetase  33.8 
 
 		 662 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.433163 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3089  Methionine--tRNA ligase  34.29 
 
 		 749 aa  47.4  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.107488  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6318  Methionine--tRNA ligase  30 
 
 		 662 aa  44.7  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.955979 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1371  cupin 2 domain-containing protein  36.26 
 
 		 372 aa  44.3  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898845 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1947  hypothetical protein  26.92 
 
 		 116 aa  43.9  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1044  methionine--tRNA ligase  30 
 
 		 671 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.120671 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2906  hypothetical protein  28.16 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.808157  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1358  cupin 2 domain-containing protein  38.57 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.660301  normal  0.0940885 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0445  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.205887 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0389  cupin 2 domain-containing protein  36.36 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0281  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.4 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1329  mannose-6-phosphate isomerase  23.26 
 
 		 112 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0501  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>