23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0281 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0281  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 122 aa  250  5.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1819  hypothetical protein  37.18 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0751  XRE family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 179 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000101746  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0485  transcriptional regulator, XRE family  28.97 
 
 		 197 aa  47.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000244144  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3329  transcriptional regulator  37.74 
 
 		 201 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.855836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2819  MerR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 192 aa  45.1  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.142376 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1036  cupin 2 domain-containing protein  31.52 
 
 		 104 aa  44.7  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.276855  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2356  transcriptional regulator, XRE family  30.36 
 
 		 188 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.190302 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0474  XRE family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 192 aa  44.7  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.554508  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1538  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  27.71 
 
 		 495 aa  43.5  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0634  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 229 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.43558 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 212 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0869  XRE family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 209 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2629  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.84 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3325  transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 		 229 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.610712  normal  0.167348 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1595  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.77 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.040843 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0570  methionine--tRNA ligase  33.77 
 
 		 659 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.755013 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2661  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.4 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 176 aa  40.8  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 201 aa  40.8  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1947  hypothetical protein  28 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0416  XRE family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 229 aa  40.8  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.387969 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  26.15 
 
 		 188 aa  40.8  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>