44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2906 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2906  hypothetical protein  100 
 
 		 106 aa  218  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.808157  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0564  hypothetical protein  87.74 
 
 		 106 aa  195  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2863  cupin 2, barrel  34.38 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.42 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.588155  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2605  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.91 
 
 		 126 aa  50.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0523242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3512  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.91 
 
 		 126 aa  50.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2287  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.21 
 
 		 125 aa  50.8  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.709012  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2588  cupin region  34.04 
 
 		 123 aa  50.4  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.362535 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00420  cupin domain-containing protein  28.43 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.33037 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1317  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.44 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2075  cupin region  29.13 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.626152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0570  methionine--tRNA ligase  26.98 
 
 		 659 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.755013 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2249  cupin 2, barrel  29.58 
 
 		 143 aa  47  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2150  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.71 
 
 		 118 aa  47  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.491101  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1358  cupin 2 domain-containing protein  34.15 
 
 		 119 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.660301  normal  0.0940885 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0766  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  31.58 
 
 		 472 aa  44.3  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1828  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0625  hypothetical protein  31.25 
 
 		 166 aa  43.9  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2411  cupin 2 domain-containing protein  28.05 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1128  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.24 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00311434  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0266  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.39 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.465169  normal  0.12222 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2148  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.84 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0024464  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4552  cupin region  27.37 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2661  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.16 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3281  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  29.17 
 
 		 476 aa  42.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2037  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.14 
 
 		 112 aa  42  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0486792  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0566  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  30 
 
 		 476 aa  42.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2150  cupin 2 domain-containing protein  24.27 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0837605 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0413  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  28.92 
 
 		 480 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6318  Methionine--tRNA ligase  26.23 
 
 		 662 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.955979 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2310  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  25.42 
 
 		 479 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0268586 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2573  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  26.83 
 
 		 490 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1439  cupin 2 domain-containing protein  36.36 
 
 		 199 aa  41.6  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.83171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2960  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  26.83 
 
 		 490 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2934  cupin 2 domain-containing protein  22.47 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.91 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1972  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25 
 
 		 143 aa  40.8  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0389  cupin 2 domain-containing protein  29.23 
 
 		 122 aa  40.8  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2919  hypothetical protein  25 
 
 		 114 aa  40.4  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000876891  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3999  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  27.38 
 
 		 476 aa  40.4  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1552  cupin 2 domain-containing protein  29.85 
 
 		 112 aa  40.4  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0206  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30 
 
 		 115 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2263  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  26.26 
 
 		 473 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000496774 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0782  Cupin 2 conserved barrel domain protein  21.88 
 
 		 115 aa  40  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0960825  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>