45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_3512 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3512  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 126 aa  262  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2605  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 126 aa  262  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0523242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2588  cupin region  57.39 
 
 		 123 aa  143  8.000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.362535 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2150  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.43 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.491101  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1856  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.32 
 
 		 118 aa  104  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0185849  hitchhiker  0.0000000000536602 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6339  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  47.32 
 
 		 160 aa  104  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399971  hitchhiker  0.000000968106 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1481  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.32 
 
 		 118 aa  104  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000853515 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4483  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.32 
 
 		 160 aa  104  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000935764 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.43 
 
 		 117 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.588155  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00420  cupin domain-containing protein  29.36 
 
 		 115 aa  73.2  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.33037 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2906  hypothetical protein  31.91 
 
 		 106 aa  50.8  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.808157  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0564  hypothetical protein  29.91 
 
 		 106 aa  51.2  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.86 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2411  cupin 2 domain-containing protein  30.53 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2127  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.71 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0206  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 115 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2148  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.34 
 
 		 133 aa  47  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0024464  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0266  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.21 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.465169  normal  0.12222 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0134  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.39 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.82 
 
 		 103 aa  45.4  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.754668  normal  0.233584 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.39 
 
 		 126 aa  45.1  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0223  cupin 2 domain-containing protein  36.62 
 
 		 114 aa  44.3  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0788  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.78 
 
 		 114 aa  43.9  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6281  hypothetical protein  34.09 
 
 		 149 aa  43.5  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2162  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000761945  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2075  cupin region  28.72 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.626152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  31.94 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0317  hypothetical protein  28.89 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.543351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2945  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.89 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.367225  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1305  cupin 2, barrel  34.78 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0335072  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2286  cupin 2 domain-containing protein  27.37 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0320  cupin 2 domain-containing protein  32.63 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.864661  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2685  hypothetical protein  33.33 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.273941  normal  0.254874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1358  cupin 2 domain-containing protein  30.49 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.660301  normal  0.0940885 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3060  cupin domain protein  29.73 
 
 		 197 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2443  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  27.71 
 
 		 450 aa  42  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3997  cupin 2 domain-containing protein  30 
 
 		 148 aa  41.2  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.439431  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1009  cupin family protein  29.27 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0553  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.34 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1593  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.41 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.147547 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1685  cupin 2 domain-containing protein  23.29 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_27889  predicted protein  38.57 
 
 		 234 aa  40.8  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.731837  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2847  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.93 
 
 		 119 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0347  Mannose-1-phosphate guanylyltransferase  31.25 
 
 		 476 aa  40.4  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2037  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.49 
 
 		 112 aa  40  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0486792  normal  0.209563 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>