32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4483 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4483  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 160 aa  331  2e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000935764 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6339  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  100 
 
 		 160 aa  331  2e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399971  hitchhiker  0.000000968106 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1856  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 118 aa  242  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0185849  hitchhiker  0.0000000000536602 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1481  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 118 aa  242  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000853515 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2150  Cupin 2 conserved barrel domain protein  72.03 
 
 		 118 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.491101  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2605  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.75 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0523242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3512  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.75 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2588  cupin region  47.32 
 
 		 123 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.362535 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.91 
 
 		 117 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.588155  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00420  cupin domain-containing protein  32.69 
 
 		 115 aa  70.5  0.000000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.33037 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2906  hypothetical protein  28.7 
 
 		 106 aa  47  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.808157  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0564  hypothetical protein  27.78 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0400  cupin 2 domain-containing protein  27.59 
 
 		 129 aa  45.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0223  cupin 2 domain-containing protein  30 
 
 		 114 aa  45.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5708  cupin 2 domain-containing protein  36.36 
 
 		 111 aa  44.3  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.203885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0206  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 115 aa  44.3  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3060  cupin domain protein  26.32 
 
 		 197 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17330  cupin domain-containing protein  32.91 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.017863  normal  0.0817952 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2982  polyketide synthesis domain protein  31.82 
 
 		 120 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2775  cupin 2 domain-containing protein  31.82 
 
 		 120 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.108544  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2260  polyketide synthesis domain protein  31.82 
 
 		 120 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0666056 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2978  polyketide synthesis domain protein  31.82 
 
 		 120 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000628046 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2981  cupin domain-containing protein  31.82 
 
 		 120 aa  42.4  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2699  hypothetical protein  31.82 
 
 		 120 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.615203  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2719  hypothetical protein  31.82 
 
 		 120 aa  42.4  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2770  cupin domain-containing protein  31.82 
 
 		 120 aa  42.4  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3018  cupin domain-containing protein  31.82 
 
 		 120 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.117139  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2148  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30 
 
 		 133 aa  42.4  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.0024464  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1358  cupin 2 domain-containing protein  31.34 
 
 		 119 aa  41.2  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.660301  normal  0.0940885 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1069  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.71 
 
 		 117 aa  40.8  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.486556 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3020  polyketide synthesis domain protein  30.3 
 
 		 120 aa  40.8  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2162  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.61 
 
 		 115 aa  40.4  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000761945  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>