30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_17330 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_17330  cupin domain-containing protein  100 
 
 		 148 aa  295  2e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.017863  normal  0.0817952 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0440  cupin 2, barrel  34.78 
 
 		 149 aa  92.4  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.351298  normal  0.537185 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1579  TonB box-like  40 
 
 		 151 aa  91.7  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1270  hypothetical protein  40.62 
 
 		 140 aa  87.4  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2200  hypothetical protein  37.1 
 
 		 163 aa  84.7  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.192403 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5302  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.61 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2969  cupin 2  33.87 
 
 		 171 aa  51.2  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0134  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.87 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1816  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 123 aa  46.2  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.337557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0692  cupin 2 domain-containing protein  36.9 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1720  cupin 2 domain-containing protein  40.98 
 
 		 94 aa  46.2  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1371  cupin 2 domain-containing protein  36.36 
 
 		 372 aa  45.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898845 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4399  polyketide synthesis domain protein  34.85 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4402  polyketide synthesis domain-containing protein  34.85 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.155389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4287  polyketide synthesis domain protein  34.85 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.640485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4469  polyketide synthesis domain-containing protein  33.33 
 
 		 116 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4317  polyketide synthesis domain protein  33.33 
 
 		 116 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1069  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.04 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.486556 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0570  methionine--tRNA ligase  31.43 
 
 		 659 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.755013 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2150  cupin 2 domain-containing protein  40 
 
 		 124 aa  41.6  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0837605 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1331  Cupin 2 conserved barrel domain protein  23.14 
 
 		 158 aa  42  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3712  cupin region  37.29 
 
 		 172 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.963003  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0973  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.7 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0389  cupin 2 domain-containing protein  28.21 
 
 		 122 aa  40.8  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10260  cupin domain-containing protein  37.68 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.227794 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1044  methionine--tRNA ligase  31.31 
 
 		 671 aa  40.4  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.120671 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5793  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.87 
 
 		 141 aa  40.4  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0814644 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.5 
 
 		 146 aa  40.4  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4053  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  39.62 
 
 		 475 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.268348  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5804  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 123 aa  40  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>