16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1720 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1720  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 94 aa  181  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17330  cupin domain-containing protein  40.98 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.017863  normal  0.0817952 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1429  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  36.07 
 
 		 280 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.670453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1444  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  36.07 
 
 		 280 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1412  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  36.07 
 
 		 280 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.212987  normal  0.035912 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1856  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  36.07 
 
 		 280 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.348031  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2029  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  36.07 
 
 		 280 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01704  DNA-binding transcriptional dual regulator  36.07 
 
 		 280 aa  40.8  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.906027  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1907  transcriptional regulator, AraC family  36.07 
 
 		 279 aa  40.8  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00680023  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1817  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  36.07 
 
 		 279 aa  40.8  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.208317  n/a   
 
 
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NC_010086  Bmul_4642  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 318 aa  40.8  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1897  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  36.07 
 
 		 279 aa  40.8  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.737431  normal  0.387468 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1456  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  36.07 
 
 		 279 aa  40.8  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.276942 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2453  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  36.07 
 
 		 279 aa  40.8  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012892  B21_01692  hypothetical protein  36.07 
 
 		 280 aa  40.8  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009253  Dred_1561  cupin 2 domain-containing protein  36 
 
 		 105 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0537861  n/a   
 
 
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