More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_01704 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01704  DNA-binding transcriptional dual regulator  100 
 
 		 280 aa  580  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.906027  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01692  hypothetical protein  100 
 
 		 280 aa  580  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1907  transcriptional regulator, AraC family  99.64 
 
 		 279 aa  576  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00680023  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1897  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  99.28 
 
 		 279 aa  574  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.737431  normal  0.387468 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1817  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  99.28 
 
 		 279 aa  574  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.208317  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2453  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  99.28 
 
 		 279 aa  574  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1456  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  98.92 
 
 		 279 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.276942 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1956  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  98.92 
 
 		 279 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2029  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  86.02 
 
 		 280 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1856  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  86.02 
 
 		 280 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.348031  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1412  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  86.02 
 
 		 280 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.212987  normal  0.035912 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1429  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  86.02 
 
 		 280 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.670453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1444  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  86.02 
 
 		 280 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1709  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  80.07 
 
 		 272 aa  467  1.0000000000000001e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1147  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  68.4 
 
 		 280 aa  392  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0420293  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3571  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  69.7 
 
 		 276 aa  392  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000174355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1094  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  69.7 
 
 		 276 aa  392  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000146314  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0837  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  65.31 
 
 		 287 aa  379  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126222 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2050  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 284 aa  88.2  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.192935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2481  AraC family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 279 aa  83.6  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0594391  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1047  AraC family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5606  transcriptional regulator, AraC family  23.05 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0545512  normal  0.986843 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0213  transcriptional regulator, AraC family protein  28.32 
 
 		 287 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00887507 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1426  transcriptional regulator, AraC family  26.34 
 
 		 292 aa  68.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.065785  normal  0.0210351 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0654  transcriptional regulator, AraC family  22.55 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0490278 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1003  DNA-binding response regulator  24.84 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1172  AraC family DNA-binding response regulator  30 
 
 		 250 aa  64.7  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409048  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3156  AraC family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1617  AraC family transcriptional regulator  22.88 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583151  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2157  two component AraC family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0322408 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1402  transcriptional regulator, AraC family  23.36 
 
 		 288 aa  61.6  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283594  normal  0.8016 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0740  transcriptional activator RhaS  25.3 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0791489 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0276  helix-turn-helix domain-containing protein  21.03 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4006  AraC family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0152362  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3383  transcriptional regulator  31.3 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.690138  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2573  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  28.24 
 
 		 345 aa  61.2  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3445  transcriptional regulator  31.3 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.68449 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3394  transcriptional regulator  31.3 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1839  AraC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0353  MSM (multiple sugar metabolism) operon regulatory protein  32.14 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2101  putative DNA-binding protein  32.26 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.326102  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0769  transcriptional regulator, AraC family  24.38 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1765  transcriptional regulator, AraC family  23.3 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1602  transcriptional regulator  34 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2890  transcriptional regulator, AraC family  24.39 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.178075  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0516  PAS sensor protein  33.7 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3754  transcriptional activator RhaS  24.9 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3842  transcriptional activator RhaS  24.9 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1945  transcriptional regulator, AraC family  34.78 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  36.99 
 
 		 1201 aa  60.1  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1599  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 361 aa  58.9  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.97604  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0079  transcriptional regulator, AraC family  34.48 
 
 		 187 aa  58.2  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.294253  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1918  transcriptional regulator, AraC family  29.57 
 
 		 327 aa  58.2  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1536  putative AraC family DNA-binding protein  41.67 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0820  HTH-type transcriptional regulator, AraC-family  24.79 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  37.21 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3986  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  23.32 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.542106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0564  AraC family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.682443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2197  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 314 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  33.68 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1747  transcriptional regulator, AraC family  23.02 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.49476  normal  0.0537138 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47910  putative transcriptional regulator  29.81 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00926121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5151  AraC family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 316 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479428  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2310  AraC family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.141971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  36.05 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2508  transcriptional regulator  27.68 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.207874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2003  AraC family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 342 aa  57  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 515 aa  57  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4847  AraC family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0189  transcriptional regulator, AraC family  35.16 
 
 		 360 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.166962 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4763  AraC family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.316833  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0094  transcriptional regulator, AraC family  35.29 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000110  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  31.33 
 
 		 285 aa  56.2  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.827796  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5440  AraC family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 315 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5422  AraC family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 315 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0424919  normal  0.013013 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1489  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  32.22 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.616641 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  29.35 
 
 		 349 aa  56.2  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  22.26 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  30.38 
 
 		 304 aa  55.8  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 513 aa  55.8  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1459  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  36 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000164097 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0574  AraC family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 311 aa  55.8  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0798057  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1733  transcriptional regulator, AraC family  35.87 
 
 		 322 aa  55.8  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0928  AraC family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 77 aa  55.8  0.0000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0265632  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0070  transcriptional regulator  26.83 
 
 		 347 aa  55.8  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.020859 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1287  AraC family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.400393 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2165  AraC family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 277 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0230  transcriptional regulator  27.54 
 
 		 315 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0068  transcriptional regulator  26.83 
 
 		 347 aa  55.5  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0711239 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0072  transcriptional regulator  26.83 
 
 		 347 aa  55.5  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000158985 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3104  response regulator receiver protein  38.96 
 
 		 266 aa  55.5  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4602  AraC family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 279 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0287774  normal  0.364439 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>