More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1094 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_1147  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  100 
 
 		 280 aa  573  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0420293  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1094  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  100 
 
 		 276 aa  573  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000146314  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3571  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  100 
 
 		 276 aa  573  1.0000000000000001e-162  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000174355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0837  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  71.75 
 
 		 287 aa  417  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126222 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01704  DNA-binding transcriptional dual regulator  69.7 
 
 		 280 aa  392  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.906027  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1907  transcriptional regulator, AraC family  69.7 
 
 		 279 aa  392  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00680023  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2453  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  69.7 
 
 		 279 aa  392  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1897  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  69.7 
 
 		 279 aa  392  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.737431  normal  0.387468 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01692  hypothetical protein  69.7 
 
 		 280 aa  392  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1817  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  69.7 
 
 		 279 aa  392  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.208317  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1456  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  69.7 
 
 		 279 aa  392  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.276942 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1956  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  69.32 
 
 		 279 aa  389  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1444  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  68.94 
 
 		 280 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1412  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  68.94 
 
 		 280 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.212987  normal  0.035912 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1856  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  68.94 
 
 		 280 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.348031  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1429  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  68.94 
 
 		 280 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.670453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2029  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  68.94 
 
 		 280 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1709  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  62.31 
 
 		 272 aa  370  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2050  AraC family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 284 aa  82  0.000000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.192935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2481  AraC family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 279 aa  75.9  0.0000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0594391  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5606  transcriptional regulator, AraC family  25.56 
 
 		 279 aa  70.1  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0545512  normal  0.986843 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0654  transcriptional regulator, AraC family  22.5 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0490278 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0740  transcriptional activator RhaS  25.56 
 
 		 273 aa  62.4  0.000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0791489 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4130  putative transcriptional regulator  30.77 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47910  putative transcriptional regulator  30.77 
 
 		 224 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00926121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5349  AraC family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 325 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3842  transcriptional activator RhaS  25.19 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3754  transcriptional activator RhaS  25.19 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0516  PAS sensor protein  32.56 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2573  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  27.4 
 
 		 345 aa  59.7  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  25.44 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1747  transcriptional regulator, AraC family  22.35 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.49476  normal  0.0537138 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1437  AraC family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 326 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2310  AraC family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 256 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.141971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0574  AraC family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0798057  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5151  AraC family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1047  transcriptional regulator, AraC family  31.03 
 
 		 273 aa  57  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0033  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 281 aa  57  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0769  transcriptional regulator, AraC family  23.85 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6135  transcriptional regulator, AraC family  28.46 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2675  transcriptional regulator, AraC family  30.85 
 
 		 344 aa  56.6  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307401  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2165  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 277 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1536  putative AraC family DNA-binding protein  40.54 
 
 		 310 aa  55.5  0.0000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0234  transcription regulator protein  23.05 
 
 		 248 aa  55.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0910  helix-turn-helix, AraC type  22.08 
 
 		 243 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2463  transcriptional regulator, AraC family  31.33 
 
 		 248 aa  54.7  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1688  AraC family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 280 aa  55.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1839  AraC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 281 aa  55.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3104  response regulator receiver protein  50.94 
 
 		 266 aa  55.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3156  AraC family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 283 aa  55.5  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1649  AraC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 303 aa  53.9  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1402  transcriptional regulator, AraC family  24.56 
 
 		 288 aa  54.3  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283594  normal  0.8016 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3855  AraC family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 285 aa  54.7  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0820  HTH-type transcriptional regulator, AraC-family  24.1 
 
 		 259 aa  54.3  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1602  transcriptional regulator  32.46 
 
 		 330 aa  53.9  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2101  putative DNA-binding protein  28.57 
 
 		 286 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.326102  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  24.9 
 
 		 287 aa  53.9  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1643  transcriptional regulator, AraC family  31.25 
 
 		 351 aa  53.9  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.671722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1287  AraC family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 260 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.400393 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0219  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  25.59 
 
 		 385 aa  53.1  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0841  transcriptional regulator, AraC family  31.18 
 
 		 300 aa  53.1  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6981  AraC family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 345 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0671274  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4602  AraC family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 279 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0287774  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5626  transcriptional regulator, AraC family  39.13 
 
 		 285 aa  53.1  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.808973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1489  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  32.58 
 
 		 323 aa  52.8  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.616641 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02106  transcriptional regulator AraC/xylS family  32.05 
 
 		 241 aa  53.1  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4301  transcriptional regulator, AraC family  29.7 
 
 		 286 aa  53.1  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.220521  normal  0.797318 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0094  transcriptional regulator, AraC family  29.36 
 
 		 185 aa  53.1  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0622  transcriptional regulator  30.86 
 
 		 340 aa  53.1  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.553854  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0474  AraC family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 284 aa  53.1  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3470  AraC family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 523 aa  52.8  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.884533  normal  0.876764 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1506  AraC family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 345 aa  52.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.570084  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1599  transcriptional regulator  32.1 
 
 		 361 aa  52.8  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.97604  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1047  AraC family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 285 aa  52.8  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3015  transcriptional regulator  21.86 
 
 		 283 aa  52.8  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.103584  normal  0.15969 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6323  AraC family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 345 aa  52.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.879961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2434  AraC family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 273 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  29.21 
 
 		 349 aa  52.8  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2157  two component AraC family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 250 aa  52.4  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0322408 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2080  transcriptional regulator, AraC family  23.87 
 
 		 271 aa  52.4  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.209158 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3379  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  32.17 
 
 		 285 aa  52  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4131  AraC family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 260 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.696726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3351  AraC family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 342 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530568  normal  0.830085 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4748  transcriptional regulator  26.85 
 
 		 326 aa  52  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.760248  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4834  transcriptional regulator  26.85 
 
 		 326 aa  52  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1509  transcriptional regulator AraC family  24.49 
 
 		 284 aa  52.4  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  30.69 
 
 		 300 aa  52  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5041  transcriptional regulator  30.68 
 
 		 331 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00544571 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 300 aa  51.6  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0092  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 312 aa  51.6  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  30.69 
 
 		 300 aa  52  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0089  AraC family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 312 aa  52  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3003  transcriptional regulator, AraC family  30.43 
 
 		 240 aa  51.6  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723875 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  24.09 
 
 		 338 aa  51.6  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2463  transcriptional regulator, AraC family  29.91 
 
 		 162 aa  52  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400735  normal  0.926275 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2823  transcriptional regulator, AraC family  31.36 
 
 		 285 aa  52  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5134  transcriptional regulator  26.85 
 
 		 326 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479216  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 300 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1553  transcriptional regulator  30.43 
 
 		 331 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.741987 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3841  transcriptional activator RhaR  24.13 
 
 		 290 aa  50.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>