More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0837 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0837  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  100 
 
 		 287 aa  597  1e-170  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126222 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1147  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  71.75 
 
 		 280 aa  417  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0420293  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3571  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  71.75 
 
 		 276 aa  417  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000174355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1094  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  71.75 
 
 		 276 aa  417  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000146314  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1444  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  65.57 
 
 		 280 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1412  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  65.57 
 
 		 280 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.212987  normal  0.035912 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1429  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  65.57 
 
 		 280 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.670453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1856  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  65.57 
 
 		 280 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.348031  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2029  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  65.57 
 
 		 280 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01704  DNA-binding transcriptional dual regulator  65.31 
 
 		 280 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.906027  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1907  transcriptional regulator, AraC family  65.31 
 
 		 279 aa  379  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00680023  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1817  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  65.31 
 
 		 279 aa  379  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.208317  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01692  hypothetical protein  65.31 
 
 		 280 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1956  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  65.31 
 
 		 279 aa  379  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1456  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  65.31 
 
 		 279 aa  379  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.276942 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1897  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  65.31 
 
 		 279 aa  379  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.737431  normal  0.387468 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2453  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  65.31 
 
 		 279 aa  379  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1709  DNA-binding transcriptional regulator ChbR  64.15 
 
 		 272 aa  375  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2050  AraC family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 284 aa  86.3  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.192935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5606  transcriptional regulator, AraC family  23.79 
 
 		 279 aa  78.2  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0545512  normal  0.986843 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2481  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0594391  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3015  transcriptional regulator  23.7 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.103584  normal  0.15969 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0516  PAS sensor protein  36.9 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3156  AraC family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 283 aa  62  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2573  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  38.1 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6135  transcriptional regulator, AraC family  36.84 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  25.09 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5349  AraC family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 325 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1047  AraC family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  24 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3470  AraC family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 523 aa  58.9  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.884533  normal  0.876764 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 338 aa  58.5  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0654  transcriptional regulator, AraC family  22.63 
 
 		 264 aa  58.9  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0490278 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2101  putative DNA-binding protein  27.39 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.326102  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2310  AraC family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.141971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2157  two component AraC family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0322408 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1489  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  32.56 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.616641 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1437  AraC family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2890  transcriptional regulator, AraC family  24.73 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.178075  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1643  transcriptional regulator, AraC family  34.48 
 
 		 351 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.671722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3855  AraC family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2714  transcriptional regulator, AraC family  22.35 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50523  normal  0.456872 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0033  transcriptional regulator, AraC family  34.15 
 
 		 281 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2640  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 329 aa  57  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15650  hypothetical protein  27.97 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000726726  hitchhiker  5.71915e-19 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5151  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0189  transcriptional regulator, AraC family  36.47 
 
 		 360 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.166962 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1602  transcriptional regulator  32.17 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1599  transcriptional regulator  34.12 
 
 		 361 aa  56.6  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.97604  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1536  putative AraC family DNA-binding protein  41.89 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0230  transcriptional regulator  27.91 
 
 		 315 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0820  HTH-type transcriptional regulator, AraC-family  25 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4130  putative transcriptional regulator  31.82 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47910  putative transcriptional regulator  31.82 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00926121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3986  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  24.1 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.542106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1047  transcriptional regulator, AraC family  32.93 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3593  AraC family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 342 aa  55.8  0.0000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1839  AraC family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2746  transcriptional regulator, AraC family  22.45 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.902284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3754  transcriptional activator RhaS  22.91 
 
 		 273 aa  55.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0740  transcriptional activator RhaS  22.89 
 
 		 273 aa  55.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0791489 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1688  AraC family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 280 aa  55.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3842  transcriptional activator RhaS  22.91 
 
 		 273 aa  55.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  29.07 
 
 		 349 aa  55.1  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3416  AraC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 279 aa  54.3  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0904858  normal  0.667905 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0341  AraC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 264 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.729431 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5008  putative transcriptional regulator  26.52 
 
 		 332 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1619  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  23.22 
 
 		 286 aa  54.3  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0667714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4961  AraC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 264 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0263791 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3060  AraC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 264 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5196  AraC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 264 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.82206  normal  0.599062 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4668  AraC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 264 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.622787 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5307  AraC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 264 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0914956 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0769  transcriptional regulator, AraC family  23.05 
 
 		 266 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1357  transcriptional regulator, AraC family  28.91 
 
 		 277 aa  53.9  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0841  transcriptional regulator, AraC family  29.03 
 
 		 300 aa  53.9  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2344  AraC family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 291 aa  53.9  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.415258  decreased coverage  0.000000160682 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0860  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 348 aa  53.9  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0897  transcriptional regulator  36.23 
 
 		 335 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0928  AraC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 77 aa  53.9  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0265632  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1402  transcriptional regulator, AraC family  23.33 
 
 		 288 aa  53.5  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283594  normal  0.8016 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0279  transcriptional regulator, AraC family  35.23 
 
 		 401 aa  53.1  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4952  helix-turn-helix domain-containing protein  32.61 
 
 		 292 aa  53.1  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017601  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0574  AraC family transcriptional regulator  22.75 
 
 		 311 aa  53.1  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0798057  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57630  AraC family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 299 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.963773 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4671  AraC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 279 aa  52.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0731  AraC family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 285 aa  53.1  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0743378  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4847  AraC family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 315 aa  52.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02106  transcriptional regulator AraC/xylS family  33.33 
 
 		 241 aa  52.8  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2752  transcriptional regulator, AraC family  23.85 
 
 		 294 aa  52.4  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.612701  hitchhiker  0.00970108 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2970  transcriptional regulator, AraC family  35.14 
 
 		 276 aa  52.4  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3117 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4301  transcriptional regulator, AraC family  32.58 
 
 		 286 aa  52.4  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.220521  normal  0.797318 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1501  transcriptional regulator  32.14 
 
 		 347 aa  52.4  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1732  AraC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 281 aa  52.4  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0878  AraC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 256 aa  52.4  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.776666  normal  0.396396 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5440  AraC family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 315 aa  52.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4748  transcriptional regulator  37.29 
 
 		 326 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.760248  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0104  AraC family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 328 aa  52.4  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5422  AraC family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 315 aa  52.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0424919  normal  0.013013 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4834  transcriptional regulator  37.29 
 
 		 326 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>