44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0973 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0973  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 118 aa  240  6e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1305  cupin 2, barrel  45.13 
 
 		 115 aa  105  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0335072  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1532  cupin 2 domain-containing protein  41.59 
 
 		 115 aa  100  5e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1488  cupin 2 domain-containing protein  41.59 
 
 		 115 aa  97.8  5e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00804045  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0206  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.13 
 
 		 115 aa  87.8  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0788  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.6 
 
 		 114 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1646  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.78 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2162  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.2 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000761945  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003224  mannose-6-phosphate isomerase  29.06 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0819  cupin 2 domain-containing protein  42.86 
 
 		 123 aa  51.6  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1603  cupin 2 domain-containing protein  41.43 
 
 		 123 aa  51.6  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2409  cupin family protein  40.58 
 
 		 114 aa  50.8  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116838  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0544  hypothetical protein, putative phage gene  28.83 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.597495  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0389  cupin 2 domain-containing protein  37.5 
 
 		 122 aa  45.1  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4297  cupin 2 domain-containing protein  31.25 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1589  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.43 
 
 		 132 aa  44.7  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.908983 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3140  mannose-6-phosphate isomerase, bifunctional enzyme  34.38 
 
 		 458 aa  44.7  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.116688  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1767  cupin 2, barrel  36.78 
 
 		 127 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0773162  normal  0.597439 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10260  cupin domain-containing protein  38.57 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.227794 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3858  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.11 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3695  cupin region  37.93 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3518  cupin 2 domain-containing protein  37.18 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4317  polyketide synthesis domain protein  36.76 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2502  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.23 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.529336 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3184  cupin region  31.76 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5302  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.39 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4469  polyketide synthesis domain-containing protein  36.76 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1779  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.78 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1605  cupin 2, barrel  36.47 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.843392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4287  polyketide synthesis domain protein  36.76 
 
 		 116 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.640485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4402  polyketide synthesis domain-containing protein  36.76 
 
 		 116 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.155389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0633  cupin 2 domain-containing protein  27.91 
 
 		 158 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643791  normal  0.229137 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4399  polyketide synthesis domain protein  36.76 
 
 		 116 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1468  cupin 2 domain-containing protein  28.57 
 
 		 190 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17330  cupin domain-containing protein  29.7 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.017863  normal  0.0817952 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4820  cupin 2, barrel  35.62 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3346  cupin 2 domain-containing protein  35.62 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4169  cupin 2 domain-containing protein  35.62 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3146  cupin 2 domain-containing protein  28.21 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2945  cupin 2 domain-containing protein  30.95 
 
 		 171 aa  41.2  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3638  cupin 2 domain-containing protein  29.73 
 
 		 152 aa  40.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3912  hypothetical protein  38.03 
 
 		 147 aa  40.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.243532  normal  0.0732889 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1041  cupin 2 domain-containing protein  37.1 
 
 		 311 aa  40  0.01  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421449  normal  0.0580221 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1864  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.62 
 
 		 144 aa  40  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>