69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5302 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_5302  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 153 aa  316  6e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1579  TonB box-like  68.31 
 
 		 151 aa  214  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0440  cupin 2, barrel  67.39 
 
 		 149 aa  202  2e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.351298  normal  0.537185 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2200  hypothetical protein  50 
 
 		 163 aa  157  5e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.192403 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1270  hypothetical protein  48.06 
 
 		 140 aa  130  7.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17330  cupin domain-containing protein  35.61 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.017863  normal  0.0817952 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  32.32 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2162  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.57 
 
 		 115 aa  52  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000761945  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1603  cupin 2 domain-containing protein  35.53 
 
 		 123 aa  51.6  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3140  mannose-6-phosphate isomerase, bifunctional enzyme  39.13 
 
 		 458 aa  50.4  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.116688  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1646  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.97 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3773  Cupin 2 conserved barrel domain protein  23.85 
 
 		 421 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.239832  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1915  cupin 2 domain-containing protein  29.79 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2026  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.74 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0456493  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1488  cupin 2 domain-containing protein  34.85 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00804045  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1904  cupin region  28.75 
 
 		 120 aa  47.8  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1386  cupin 2 domain-containing protein  34.15 
 
 		 116 aa  47.4  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0134  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1044  methionine--tRNA ligase  35.59 
 
 		 671 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.120671 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.46 
 
 		 257 aa  45.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2414  hypothetical protein  32.91 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.478977  normal  0.947675 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1397  cupin 2 domain-containing protein  28.92 
 
 		 115 aa  46.2  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0319163  normal  0.27943 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1009  cupin family protein  33.33 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4402  polyketide synthesis domain-containing protein  35.62 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.155389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4399  polyketide synthesis domain protein  35.62 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4287  polyketide synthesis domain protein  35.62 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.640485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4469  polyketide synthesis domain-containing protein  35.62 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1285  cupin region  32.18 
 
 		 113 aa  44.7  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  30.39 
 
 		 163 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4317  polyketide synthesis domain protein  35.62 
 
 		 116 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01320  hypothetical protein  29.47 
 
 		 122 aa  44.3  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.333196  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5708  cupin 2 domain-containing protein  27.27 
 
 		 111 aa  44.3  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.203885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2827  hypothetical protein  30.68 
 
 		 255 aa  43.9  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2286  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.78 
 
 		 364 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2525  gentisate 1,2-dioxygenase  32.43 
 
 		 345 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2324  gentisate 1,2-dioxygenase  32.43 
 
 		 345 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2417  gentisate 1,2-dioxygenase  32.43 
 
 		 345 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1069  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.53 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.486556 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0589  cupin 2 domain-containing protein  30.26 
 
 		 361 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2368  gentisate 1,2-dioxygenase  32.43 
 
 		 345 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0793193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0468  cupin 2 domain-containing protein  30.26 
 
 		 361 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1633  cupin 2 domain-containing protein  28.41 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0677  cupin 2 domain-containing protein  30.26 
 
 		 255 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1601  cupin 2 domain-containing protein  30.26 
 
 		 361 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1532  cupin 2 domain-containing protein  31.82 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2413  gentisate 1,2-dioxygenase  32.43 
 
 		 345 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00345  cupin domain protein  37.88 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00219915  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1654  cupin 2 domain-containing protein  29.85 
 
 		 361 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0973  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.39 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3146  cupin 2 domain-containing protein  25.77 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1628  cupin 2, barrel  30.26 
 
 		 356 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  32.84 
 
 		 150 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2629  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.85 
 
 		 138 aa  42.4  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0912  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.32 
 
 		 125 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2813  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.59 
 
 		 350 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1305  cupin 2, barrel  25.58 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0335072  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1882  auxin-binding protein, putative  32.14 
 
 		 167 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33680  Protein of unknown function (DUF861)  34.25 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0735  cupin 2 domain-containing protein  40.54 
 
 		 178 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0389  cupin 2 domain-containing protein  23.77 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3716  cupin 2, barrel  25.37 
 
 		 129 aa  41.2  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000701811  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8561  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.37 
 
 		 140 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853837  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.47 
 
 		 117 aa  40.8  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.588155  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6318  Methionine--tRNA ligase  35.59 
 
 		 662 aa  40.8  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.955979 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2141  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.43 
 
 		 159 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  23.01 
 
 		 149 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3746  cupin 2 domain-containing protein  28.57 
 
 		 124 aa  40.4  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0692  cupin 2 domain-containing protein  26.19 
 
 		 163 aa  40.4  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2394  cupin 2 domain-containing protein  31.51 
 
 		 151 aa  40.4  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00264239  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>