62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0440 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_0440  cupin 2, barrel  100 
 
 		 149 aa  311  1.9999999999999998e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.351298  normal  0.537185 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1579  TonB box-like  69.78 
 
 		 151 aa  215  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5302  Cupin 2 conserved barrel domain protein  67.39 
 
 		 153 aa  202  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2200  hypothetical protein  49.28 
 
 		 163 aa  143  1e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.192403 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1270  hypothetical protein  44.96 
 
 		 140 aa  124  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17330  cupin domain-containing protein  34.78 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.017863  normal  0.0817952 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1603  cupin 2 domain-containing protein  30.77 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1904  cupin region  38.16 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  28.42 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0134  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.37 
 
 		 118 aa  50.4  0.000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2026  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.25 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0456493  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1009  cupin family protein  34.67 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4126  cupin 2 domain-containing protein  31.71 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3773  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.61 
 
 		 421 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.239832  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  30.56 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  29.47 
 
 		 150 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1827  hypothetical protein  32.94 
 
 		 121 aa  47.4  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1532  cupin 2 domain-containing protein  38.46 
 
 		 115 aa  47  0.00008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5708  cupin 2 domain-containing protein  28.71 
 
 		 111 aa  47.4  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.203885  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3200  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  36.21 
 
 		 512 aa  46.2  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1488  cupin 2 domain-containing protein  40 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00804045  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.37 
 
 		 192 aa  45.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3712  cupin region  36.51 
 
 		 172 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.963003  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0577  hypothetical protein  31.71 
 
 		 125 aa  44.7  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.116523  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2847  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.77 
 
 		 119 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1882  auxin-binding protein, putative  34.15 
 
 		 167 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1459  hypothetical protein  27.45 
 
 		 332 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0434689  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2228  cupin 2 domain-containing protein  31.63 
 
 		 166 aa  43.5  0.0009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000300974 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1043  cupin 2 domain-containing protein  29.66 
 
 		 181 aa  42.7  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2143  transcriptional regulator, AraC family  32.91 
 
 		 278 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1397  cupin 2 domain-containing protein  27.38 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0319163  normal  0.27943 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3001  cupin 2 domain-containing protein  35.29 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2053  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.52 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2394  cupin 2 domain-containing protein  31.58 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00264239  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0371  bicupin, oxalate decarboxylase family  29.09 
 
 		 404 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.571775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.43 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33680  Protein of unknown function (DUF861)  28.57 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.41 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1228  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.56 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.066401  normal  0.685252 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1444  cupin 2 domain-containing protein  25.64 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2409  cupin family protein  29.11 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116838  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1069  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.26 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.486556 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3140  mannose-6-phosphate isomerase, bifunctional enzyme  33.33 
 
 		 458 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.116688  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.34 
 
 		 146 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.13 
 
 		 257 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2183  bicupin, oxalate decarboxylase family  32.56 
 
 		 384 aa  42  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2072  auxin-binding protein, putative  35.53 
 
 		 167 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0382674  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1023  cupin 2 domain-containing protein  28.74 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.25 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.492542  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1329  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.92 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2629  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.15 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2672  hypothetical protein  32.14 
 
 		 159 aa  40.8  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.311364  normal  0.391613 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0692  cupin 2 domain-containing protein  29.79 
 
 		 163 aa  40.8  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2621  mannose-1-phosphate guanylyltransferase  32.76 
 
 		 465 aa  40.8  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4297  cupin 2 domain-containing protein  30.49 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1329  mannose-6-phosphate isomerase  31.03 
 
 		 112 aa  40.4  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0501  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0104  cupin  29.23 
 
 		 122 aa  40.8  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.300673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2173  mannose-1-phosphate guanylyltransferase  31.75 
 
 		 471 aa  40.4  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0774935  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003224  mannose-6-phosphate isomerase  33.33 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0784  cupin 2 domain-containing protein  31.51 
 
 		 129 aa  40.4  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0399886  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0452  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.77 
 
 		 136 aa  40  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0402  bicupin, oxalate decarboxylase family  28.18 
 
 		 404 aa  40  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.861289  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>