46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4381 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 
117 aa  246  9e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.588155  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00420  cupin domain-containing protein  33.33 
 
 
115 aa  89  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.33037 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2150  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.91 
 
 
118 aa  84  7e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.491101  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3512  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.43 
 
 
126 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2605  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.43 
 
 
126 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0523242  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4483  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.04 
 
 
160 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000935764 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1856  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.04 
 
 
118 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0185849  hitchhiker  0.0000000000536602 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1481  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.04 
 
 
118 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000853515 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6339  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  34.04 
 
 
160 aa  72.4  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399971  hitchhiker  0.000000968106 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2588  cupin region  32.71 
 
 
123 aa  67  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.362535 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2863  cupin 2, barrel  33.94 
 
 
107 aa  64.7  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2162  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.78 
 
 
115 aa  60.5  0.000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000761945  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2906  hypothetical protein  26.42 
 
 
106 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.808157  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0564  hypothetical protein  26.17 
 
 
106 aa  57.8  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1358  cupin 2 domain-containing protein  32.93 
 
 
119 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.660301  normal  0.0940885 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0553  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.61 
 
 
136 aa  51.2  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2945  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.89 
 
 
136 aa  50.4  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.367225  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1488  cupin 2 domain-containing protein  33.78 
 
 
115 aa  48.9  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00804045  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1532  cupin 2 domain-containing protein  32.91 
 
 
115 aa  47  0.00009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0525  13S globulin  41.03 
 
 
88 aa  45.8  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1646  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.76 
 
 
116 aa  45.8  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1599  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.94 
 
 
108 aa  44.7  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00522565 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2127  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.53 
 
 
109 aa  43.9  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3399  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.53 
 
 
173 aa  44.3  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2287  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.59 
 
 
125 aa  43.5  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.709012  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2583  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.13 
 
 
115 aa  42.7  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3018  cupin domain-containing protein  28 
 
 
120 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.117139  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2260  polyketide synthesis domain protein  28 
 
 
120 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0666056 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3146  cupin 2 domain-containing protein  31.03 
 
 
134 aa  42.7  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2775  cupin 2 domain-containing protein  28 
 
 
120 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.108544  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3746  cupin 2 domain-containing protein  33.8 
 
 
124 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2982  polyketide synthesis domain protein  28 
 
 
120 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2238  mannose-1-phosphate guanylyltransferase  31.43 
 
 
127 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201332  normal  0.554394 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2827  hypothetical protein  32.89 
 
 
255 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1317  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.07 
 
 
112 aa  41.6  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2978  polyketide synthesis domain protein  26.67 
 
 
120 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000628046 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2981  cupin domain-containing protein  26.67 
 
 
120 aa  41.6  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2699  hypothetical protein  26.67 
 
 
120 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.615203  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2719  hypothetical protein  26.67 
 
 
120 aa  41.6  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2770  cupin domain-containing protein  26.67 
 
 
120 aa  41.6  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1579  TonB box-like  27.37 
 
 
151 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694121  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.95 
 
 
146 aa  41.2  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5302  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.47 
 
 
153 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1069  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.23 
 
 
117 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.486556 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1073  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.47 
 
 
175 aa  40.4  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000222691  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  31.58 
 
 
137 aa  40.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>