78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00345 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00345  cupin domain protein  100 
 
 		 121 aa  250  5.000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00219915  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3023  cupin 2, barrel  46.02 
 
 		 113 aa  115  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0652  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.52 
 
 		 112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1444  cupin 2 domain-containing protein  41.28 
 
 		 132 aa  99  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2662  cupin 2 domain-containing protein  39.5 
 
 		 119 aa  96.7  9e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4126  cupin 2 domain-containing protein  38.46 
 
 		 119 aa  96.7  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4399  polyketide synthesis domain protein  35.87 
 
 		 116 aa  63.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4287  polyketide synthesis domain protein  35.87 
 
 		 116 aa  63.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.640485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4402  polyketide synthesis domain-containing protein  35.87 
 
 		 116 aa  63.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.155389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4469  polyketide synthesis domain-containing protein  35.87 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4317  polyketide synthesis domain protein  35.87 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  31.17 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2629  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.87 
 
 		 138 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8561  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853837  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.9 
 
 		 165 aa  47.8  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.38 
 
 		 166 aa  47.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0967  hypothetical protein  38.55 
 
 		 153 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.410205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0211  hypothetical protein  35.48 
 
 		 278 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.986717 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.23 
 
 		 332 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3020  polyketide synthesis domain protein  27.27 
 
 		 120 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0866  cupin 2 domain-containing protein  36.36 
 
 		 333 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.647462  normal  0.208586 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0633  cupin 2 domain-containing protein  40 
 
 		 158 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643791  normal  0.229137 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2060  hypothetical protein  31.07 
 
 		 279 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.122553  normal  0.0117178 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5329  hypothetical protein  33.87 
 
 		 278 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4827  hypothetical protein  33.87 
 
 		 278 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.576773 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5420  hypothetical protein  33.87 
 
 		 278 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120325  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5442  hypothetical protein  33.87 
 
 		 278 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.529147 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4787  hypothetical protein  33.87 
 
 		 278 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.133323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2409  cupin family protein  32.31 
 
 		 114 aa  44.3  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116838  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0912  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.21 
 
 		 125 aa  44.3  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5786  cupin 2 conserved barrel domain protein  30.77 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242076  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2981  cupin domain-containing protein  27.27 
 
 		 120 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2978  polyketide synthesis domain protein  27.27 
 
 		 120 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000628046 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2719  hypothetical protein  27.27 
 
 		 120 aa  43.9  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2770  cupin domain-containing protein  27.27 
 
 		 120 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3018  cupin domain-containing protein  27.27 
 
 		 120 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.117139  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2982  polyketide synthesis domain protein  27.27 
 
 		 120 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2260  polyketide synthesis domain protein  27.27 
 
 		 120 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0666056 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2964  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.48 
 
 		 160 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2775  cupin 2 domain-containing protein  27.27 
 
 		 120 aa  43.9  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.108544  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5168  cupin 2, barrel  31.87 
 
 		 143 aa  43.9  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.244444 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1904  cupin region  29.29 
 
 		 120 aa  43.5  0.0009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5302  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.88 
 
 		 153 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4703  cupin 2 domain-containing protein  32.11 
 
 		 154 aa  43.5  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.835831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3746  cupin 2 domain-containing protein  28.57 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2699  hypothetical protein  27 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.615203  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3712  cupin region  33.8 
 
 		 172 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.963003  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4505  cupin 2 domain-containing protein  34.21 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3330  hypothetical protein  33.87 
 
 		 278 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0228247 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  24 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3647  cupin 2 domain-containing protein  28.4 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  32.05 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1459  hypothetical protein  31.82 
 
 		 332 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0434689  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1207  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.56 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3295  hypothetical protein  33.87 
 
 		 278 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2973  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  28 
 
 		 274 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1741  hypothetical protein  30.1 
 
 		 279 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1085  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.26 
 
 		 168 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0204  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.85 
 
 		 160 aa  41.6  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.2 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5737  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.51 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1579  TonB box-like  32.79 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5028  cupin 2 domain-containing protein  32.88 
 
 		 210 aa  41.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7188  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.14 
 
 		 152 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0147  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.85 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4304  hypothetical protein  31.58 
 
 		 278 aa  40.8  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.208475 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0950  cupin 2 domain-containing protein  34.21 
 
 		 157 aa  40.8  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0577  hypothetical protein  25 
 
 		 125 aa  40.8  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.116523  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3472  hypothetical protein  32.84 
 
 		 276 aa  40.8  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.489268  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6664  hypothetical protein  30.77 
 
 		 272 aa  40.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00516575 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0121  hypothetical protein  34.15 
 
 		 242 aa  40.4  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3617  hypothetical protein  32.26 
 
 		 278 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4979  cupin region  32.56 
 
 		 155 aa  40.4  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6639  cupin 2 domain-containing protein  29.7 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0292958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2790  cupin 2 domain-containing protein  33.8 
 
 		 153 aa  40  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2420  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.82 
 
 		 284 aa  40  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00497597 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3638  cupin 2 domain-containing protein  27.17 
 
 		 152 aa  40  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0557412 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>