37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2662 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2662  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 119 aa  247  3e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3023  cupin 2, barrel  57.14 
 
 		 113 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0652  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.61 
 
 		 112 aa  121  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4126  cupin 2 domain-containing protein  46.22 
 
 		 119 aa  111  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00345  cupin domain protein  39.5 
 
 		 121 aa  96.7  9e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00219915  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1444  cupin 2 domain-containing protein  37.96 
 
 		 132 aa  85.5  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1904  cupin region  32.47 
 
 		 120 aa  51.6  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2409  cupin family protein  33.75 
 
 		 114 aa  47.4  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116838  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2161  cupin 2 domain-containing protein  32.99 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0191913  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4469  polyketide synthesis domain-containing protein  27.17 
 
 		 116 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4317  polyketide synthesis domain protein  27.17 
 
 		 116 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4287  polyketide synthesis domain protein  27.17 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.640485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4399  polyketide synthesis domain protein  27.17 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4402  polyketide synthesis domain-containing protein  27.17 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.155389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1030  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.07 
 
 		 172 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1358  cupin 2 domain-containing protein  30.88 
 
 		 119 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.660301  normal  0.0940885 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.69 
 
 		 103 aa  43.5  0.0009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.754668  normal  0.233584 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58380  putative transcriptional regulator  32 
 
 		 187 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.99 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8561  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.81 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853837  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1033  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.07 
 
 		 172 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.714129  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5113  putative transcriptional regulator  32 
 
 		 187 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0971  cupin domain-containing protein  36.07 
 
 		 171 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.341283  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5786  cupin 2 conserved barrel domain protein  35.53 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242076  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1922  cupin 2 domain-containing protein  34.67 
 
 		 347 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3001  cupin 2 domain-containing protein  31.25 
 
 		 124 aa  41.2  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1085  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.5 
 
 		 168 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3011  hypothetical protein  31.34 
 
 		 279 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0659197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1009  cupin family protein  28.57 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1599  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  34.83 
 
 		 474 aa  41.2  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.225749  normal  0.701374 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.69 
 
 		 163 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1644  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.88 
 
 		 154 aa  40.8  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.522674  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1285  cupin region  29.51 
 
 		 113 aa  40.4  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2790  cupin 2 domain-containing protein  33.85 
 
 		 153 aa  40.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1117  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.85 
 
 		 159 aa  40.4  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.136519  normal  0.299442 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0837  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.25 
 
 		 130 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0147  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30 
 
 		 141 aa  40  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>