53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3001 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3001  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 
124 aa  259  1e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2847  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.31 
 
 
119 aa  118  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0104  cupin  47.46 
 
 
122 aa  112  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.300673  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1023  cupin 2 domain-containing protein  35.59 
 
 
120 aa  88.2  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1757  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.12 
 
 
125 aa  85.1  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.128793  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2973  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.84 
 
 
274 aa  78.6  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  34.15 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2629  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.1 
 
 
138 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  35.85 
 
 
137 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1904  cupin region  33.65 
 
 
120 aa  57.4  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1009  cupin family protein  32.35 
 
 
119 aa  55.5  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13508  hypothetical protein  29.46 
 
 
177 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0134  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.02 
 
 
118 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.59 
 
 
128 aa  50.8  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.492542  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4126  cupin 2 domain-containing protein  30 
 
 
119 aa  50.8  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1827  hypothetical protein  30.1 
 
 
121 aa  47.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0577  hypothetical protein  33.04 
 
 
125 aa  47  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.116523  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2409  cupin family protein  29.27 
 
 
114 aa  46.2  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116838  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2273  cupin 2 domain-containing protein  35.59 
 
 
116 aa  45.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8561  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.71 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853837  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3661  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.27 
 
 
218 aa  46.2  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3011  hypothetical protein  33.9 
 
 
279 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0659197  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0652  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.07 
 
 
112 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1072  hypothetical protein  41.3 
 
 
279 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.278788  normal  0.0185429 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.36 
 
 
126 aa  45.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5804  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.73 
 
 
123 aa  44.7  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1579  TonB box-like  33.96 
 
 
151 aa  44.3  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694121  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2037  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32 
 
 
112 aa  43.9  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0486792  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.11 
 
 
125 aa  43.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07738  hypothetical protein  36.54 
 
 
173 aa  43.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0440  cupin 2, barrel  35.29 
 
 
149 aa  43.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.351298  normal  0.537185 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0555  hypothetical protein  39.13 
 
 
279 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3023  cupin 2, barrel  30.26 
 
 
113 aa  43.5  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1325  hypothetical protein  36.96 
 
 
280 aa  42.7  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0226639  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08180  hypothetical protein  35.85 
 
 
280 aa  42.7  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.874298  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6318  Methionine--tRNA ligase  30.14 
 
 
662 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.955979 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0545  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.85 
 
 
131 aa  42.7  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0602  Cupin 2 conserved barrel domain protein  22.97 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2060  hypothetical protein  39.13 
 
 
279 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.122553  normal  0.0117178 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0389  cupin 2 domain-containing protein  38.78 
 
 
122 aa  42.7  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1921  hypothetical protein  32.61 
 
 
278 aa  42.7  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3089  Methionine--tRNA ligase  31.75 
 
 
749 aa  42  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.107488  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1350  cupin 2 domain-containing protein  27.5 
 
 
287 aa  42  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.832765  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0079  hypothetical protein  36.96 
 
 
282 aa  42  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0441  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.54 
 
 
132 aa  41.2  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2662  cupin 2 domain-containing protein  31.25 
 
 
119 aa  41.2  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1915  cupin 2 domain-containing protein  28.99 
 
 
129 aa  41.2  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0570  methionine--tRNA ligase  29.55 
 
 
659 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.755013 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0912  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.96 
 
 
125 aa  40.8  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02920  L-ectoine synthase  27.35 
 
 
137 aa  40.8  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1741  hypothetical protein  36.96 
 
 
279 aa  40.8  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1603  cupin 2 domain-containing protein  20.55 
 
 
123 aa  40.4  0.009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1044  methionine--tRNA ligase  28.77 
 
 
671 aa  40.4  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.120671 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>