36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1085 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1085  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 168 aa  340  7e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2501  cupin 2 domain-containing protein  64.29 
 
 		 135 aa  156  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.342935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2392  cupin 2 domain-containing protein  56.15 
 
 		 140 aa  154  7e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.232938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33680  Protein of unknown function (DUF861)  58.82 
 
 		 147 aa  152  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2685  cupin 2 domain-containing protein  61.61 
 
 		 134 aa  149  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477579  hitchhiker  0.0004758 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2852  cupin 2  58.06 
 
 		 156 aa  146  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0147  Cupin 2 conserved barrel domain protein  56.78 
 
 		 141 aa  142  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4149  hypothetical protein  51.88 
 
 		 150 aa  139  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26535  decreased coverage  0.0023385 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3333  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50.42 
 
 		 294 aa  119  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0663795  normal  0.136427 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5786  cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242076  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1816  cupin 2 domain-containing protein  36.08 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.337557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3023  cupin 2, barrel  42.86 
 
 		 113 aa  51.2  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6281  hypothetical protein  34.07 
 
 		 149 aa  46.6  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3716  cupin 2, barrel  33.33 
 
 		 129 aa  46.2  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000701811  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  29.29 
 
 		 150 aa  45.4  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1459  hypothetical protein  32.95 
 
 		 332 aa  45.1  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0434689  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3745  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  35.38 
 
 		 478 aa  44.7  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.35 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.78 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1009  cupin family protein  25.23 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3638  cupin 2 domain-containing protein  28.57 
 
 		 152 aa  43.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0901  XRE family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 181 aa  42.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108423 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8561  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.77 
 
 		 140 aa  42.4  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853837  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1041  cupin 2 domain-containing protein  40.28 
 
 		 311 aa  42  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421449  normal  0.0580221 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31 
 
 		 332 aa  41.6  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1207  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.17 
 
 		 152 aa  41.6  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2662  cupin 2 domain-containing protein  37.5 
 
 		 119 aa  41.6  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13981  mannose-1-phosphate guanylyltransferase  27.72 
 
 		 480 aa  41.6  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00345  cupin domain protein  32.26 
 
 		 121 aa  41.6  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00219915  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5028  cupin 2 domain-containing protein  32.91 
 
 		 210 aa  41.6  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4126  cupin 2 domain-containing protein  30.36 
 
 		 119 aa  41.6  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3325  mannose-6-phosphate isomerase, type II  37.29 
 
 		 448 aa  41.2  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.321079 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1524  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  32.31 
 
 		 470 aa  40.8  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  26.83 
 
 		 137 aa  40.8  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2540  Cro/CI family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 181 aa  40.8  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0737  cupin 2 domain-containing protein  28.43 
 
 		 207 aa  40.8  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>