31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_5028 on replicon NC_009973
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009973  Haur_5028  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 210 aa  429  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0884  cupin 2, barrel  40.22 
 
 		 191 aa  124  8.000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35 
 
 		 184 aa  109  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0119  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.56 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.338448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1447  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.41 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.901222  normal  0.428247 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0633  cupin 2 domain-containing protein  32.48 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643791  normal  0.229137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4149  hypothetical protein  38.74 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26535  decreased coverage  0.0023385 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1207  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.88 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33680  Protein of unknown function (DUF861)  39.19 
 
 		 147 aa  54.7  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741976  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10448  hypothetical protein  25.69 
 
 		 179 aa  53.9  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3716  cupin 2, barrel  33.03 
 
 		 129 aa  50.8  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000701811  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3638  cupin 2 domain-containing protein  31.4 
 
 		 152 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2685  hypothetical protein  33.78 
 
 		 152 aa  47.4  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.273941  normal  0.254874 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2161  cupin 2 domain-containing protein  37.31 
 
 		 152 aa  46.6  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0191913  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2609  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.88 
 
 		 160 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2852  cupin 2  35.14 
 
 		 156 aa  45.4  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5098  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.36 
 
 		 124 aa  45.1  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1714  cupin 2 domain-containing protein  36 
 
 		 150 aa  45.1  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3189  cupin 2, barrel  35.79 
 
 		 190 aa  44.7  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000805068  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0825  cupin 2 domain-containing protein  32.65 
 
 		 136 aa  43.5  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3997  cupin 2 domain-containing protein  32.5 
 
 		 148 aa  43.9  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.439431  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1228  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.2 
 
 		 135 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.066401  normal  0.685252 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  27.88 
 
 		 163 aa  43.1  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2392  cupin 2 domain-containing protein  33.78 
 
 		 140 aa  42.7  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.232938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3647  cupin 2 domain-containing protein  29.35 
 
 		 149 aa  42  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1644  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.35 
 
 		 154 aa  42  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.522674  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1085  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.91 
 
 		 168 aa  41.6  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0144  cupin 2 domain-containing protein  32.11 
 
 		 165 aa  41.6  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.67 
 
 		 165 aa  41.6  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4406  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.7 
 
 		 169 aa  41.6  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0295153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1504  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40 
 
 		 111 aa  41.6  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.220487  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>