118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2685 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2685  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 134 aa  265  2e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477579  hitchhiker  0.0004758 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2501  cupin 2 domain-containing protein  90.98 
 
 		 135 aa  220  4.9999999999999996e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.342935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4149  hypothetical protein  61.6 
 
 		 150 aa  152  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26535  decreased coverage  0.0023385 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1085  Cupin 2 conserved barrel domain protein  59.48 
 
 		 168 aa  149  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33680  Protein of unknown function (DUF861)  58.47 
 
 		 147 aa  141  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2392  cupin 2 domain-containing protein  57.89 
 
 		 140 aa  137  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.232938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2852  cupin 2  57.39 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0147  Cupin 2 conserved barrel domain protein  55.93 
 
 		 141 aa  130  6.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3333  Cupin 2 conserved barrel domain protein  54.24 
 
 		 294 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0663795  normal  0.136427 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.14 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1397  cupin 2 domain-containing protein  35.71 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0319163  normal  0.27943 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1009  cupin family protein  27.93 
 
 		 119 aa  53.5  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0134  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.07 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  27.91 
 
 		 137 aa  52.8  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3638  cupin 2 domain-containing protein  34.18 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3716  cupin 2, barrel  32.05 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000701811  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  30.21 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.91 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0389  cupin 2 domain-containing protein  26.32 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1036  cupin 2 domain-containing protein  32.14 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.276855  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1595  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 123 aa  47.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.040843 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1816  cupin 2 domain-containing protein  34.25 
 
 		 123 aa  47.8  0.00006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.337557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2629  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.31 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2094  transcriptional regulator Cro/CI family protein  31.97 
 
 		 188 aa  47  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18490  mannose-6-phosphate isomerase  32.31 
 
 		 127 aa  47  0.00009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.151918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3146  cupin 2 domain-containing protein  29.52 
 
 		 134 aa  47  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1041  cupin 2 domain-containing protein  38.71 
 
 		 311 aa  47  0.00009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421449  normal  0.0580221 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2770  cupin domain-containing protein  27.47 
 
 		 120 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2719  hypothetical protein  27.47 
 
 		 120 aa  46.2  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2981  cupin domain-containing protein  27.47 
 
 		 120 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3023  cupin 2, barrel  42 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2440  hypothetical protein  41.67 
 
 		 129 aa  46.2  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542121  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2978  polyketide synthesis domain protein  27.47 
 
 		 120 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000628046 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.38 
 
 		 132 aa  46.2  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3858  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.96 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1207  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.99 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4136  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.63 
 
 		 127 aa  46.2  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08099  oxalate decarboxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14610)  30.09 
 
 		 477 aa  45.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361819  normal  0.0552946 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3018  cupin domain-containing protein  27.47 
 
 		 120 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.117139  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2699  hypothetical protein  27.47 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.615203  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1386  cupin 2 domain-containing protein  31.48 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2775  cupin 2 domain-containing protein  27.47 
 
 		 120 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.108544  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2982  polyketide synthesis domain protein  27.47 
 
 		 120 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2260  polyketide synthesis domain protein  27.47 
 
 		 120 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0666056 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.97 
 
 		 128 aa  45.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.492542  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0602  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.55 
 
 		 118 aa  45.1  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2761  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.97 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.668807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1148  AraC family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 323 aa  45.1  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00767065  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3020  polyketide synthesis domain protein  26.37 
 
 		 120 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0737  cupin 2 domain-containing protein  27 
 
 		 207 aa  44.3  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0980  XRE family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 181 aa  44.7  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000294477  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3499  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.52 
 
 		 161 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.163476 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3175  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.52 
 
 		 161 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.20235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1491  cupin:protein of unknown function DUF861  38.16 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1734  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  33.33 
 
 		 455 aa  44.3  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3192  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  29.23 
 
 		 486 aa  44.3  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.764858  normal  0.047158 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4135  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  30.38 
 
 		 469 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.500124  normal  0.71949 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4617  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  30.38 
 
 		 469 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0274196  normal  0.929739 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4503  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  30.38 
 
 		 469 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.930228  normal  0.622419 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2540  Cro/CI family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 181 aa  43.9  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0450  XRE family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 180 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3906  cupin 2 domain-containing protein  48.15 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000227782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1603  cupin 2 domain-containing protein  35.38 
 
 		 123 aa  43.9  0.0007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1524  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  35.09 
 
 		 470 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0751  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 179 aa  43.9  0.0009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000101746  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1904  cupin region  27.03 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0901  XRE family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108423 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3065  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  35.38 
 
 		 450 aa  43.5  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.861502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0773  cupin 2 protein  30.77 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.707426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4181  cupin 2, barrel  38.24 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6494  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  34.38 
 
 		 514 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.91925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3325  mannose-6-phosphate isomerase, type II  34.55 
 
 		 448 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.321079 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4247  cupin 2 domain-containing protein  38.24 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.308806 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4403  cupin 2 domain-containing protein  38.24 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707936  normal  0.738548 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1335  cupin 2 domain-containing protein  30.69 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000568302  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2443  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  33.85 
 
 		 450 aa  43.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3181  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  32.31 
 
 		 462 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.825175  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1351  cupin 2 domain-containing protein  30.69 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00886277  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1129  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  34.38 
 
 		 514 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.511007 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2620  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.76 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.824016 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1329  mannose-6-phosphate isomerase  28.33 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0501  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13981  mannose-1-phosphate guanylyltransferase  26.15 
 
 		 480 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1633  cupin 2 domain-containing protein  29.9 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.905106  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3997  cupin 2 domain-containing protein  30.77 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.439431  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4126  cupin 2 domain-containing protein  31.58 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.43 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2502  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.43 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.529336 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1827  hypothetical protein  24.32 
 
 		 121 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4841  cupin 2 domain-containing protein  35.94 
 
 		 202 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3867  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.13 
 
 		 145 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.468547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4578  cupin 2 domain-containing protein  36.76 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.753369 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  27.94 
 
 		 188 aa  41.6  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2079  Mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  31.03 
 
 		 488 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1314  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  27.87 
 
 		 476 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.79469  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13701  mannose-1-phosphate guanylyltransferase  26.56 
 
 		 480 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 176 aa  41.2  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0452  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.59 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1452  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  28.99 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.760539  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1649  mannose-6-phosphate isomerase  28.99 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.315092  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2475  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  32.26 
 
 		 505 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.21987 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>