51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3333 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_3333  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 294 aa  592  1e-168  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0663795  normal  0.136427 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1089  cyclase/dehydrase  64.58 
 
 		 151 aa  187  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2686  cyclase/dehydrase  63.89 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.166242  hitchhiker  0.000545483 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2391  cyclase/dehydrase  60.27 
 
 		 164 aa  182  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.290127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4153  hypothetical protein  58.82 
 
 		 160 aa  182  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0556461  decreased coverage  0.00228502 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0149  Polyketide cyclase/dehydrase  60.26 
 
 		 167 aa  181  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2853  cyclase/dehydrase  56.94 
 
 		 162 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2502  cyclase/dehydrase  59.72 
 
 		 239 aa  170  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33720  polyketide cyclase / dehydrase family protein  53.79 
 
 		 155 aa  159  4e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4270  Polyketide cyclase/dehydrase  47.3 
 
 		 157 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259167  normal  0.925027 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33680  Protein of unknown function (DUF861)  55.65 
 
 		 147 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2392  cupin 2 domain-containing protein  52.8 
 
 		 140 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.232938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2501  cupin 2 domain-containing protein  60.19 
 
 		 135 aa  127  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.342935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2685  cupin 2 domain-containing protein  55.56 
 
 		 134 aa  119  7.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477579  hitchhiker  0.0004758 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0147  Cupin 2 conserved barrel domain protein  53.33 
 
 		 141 aa  117  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2852  cupin 2  50 
 
 		 156 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4149  hypothetical protein  50.41 
 
 		 150 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26535  decreased coverage  0.0023385 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1085  Cupin 2 conserved barrel domain protein  49.57 
 
 		 168 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2197  cyclase/dehydrase  33.12 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3550  cyclase/dehydrase  27.39 
 
 		 316 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4143  actinorhodin polyketide synthase bifunctional cyclase/dehydratase  31.69 
 
 		 318 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1222  actinorhodin polyketide synthase bifunctional cyclase/dehydratase  29.08 
 
 		 314 aa  62.4  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.521023  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.48 
 
 		 146 aa  55.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3638  cupin 2 domain-containing protein  30.97 
 
 		 152 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5786  cupin 2 conserved barrel domain protein  33.02 
 
 		 135 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242076  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1043  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 181 aa  50.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  33.71 
 
 		 150 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1009  cupin family protein  29.73 
 
 		 119 aa  48.1  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3997  cupin 2 domain-containing protein  39.13 
 
 		 148 aa  47.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.439431  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3304  signal peptide protein  38.16 
 
 		 155 aa  48.1  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0282721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3499  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.08 
 
 		 161 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.163476 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1207  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 152 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3858  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.14 
 
 		 133 aa  47  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3175  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.96 
 
 		 161 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.20235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3791  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.96 
 
 		 159 aa  47  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302037  normal  0.0222415 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5854  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 137 aa  45.8  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.154077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1816  cupin 2 domain-containing protein  28.97 
 
 		 123 aa  45.8  0.0008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.337557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4151  actinorhodin polyketide synthase bifunctional cyclase/dehydratase  25.58 
 
 		 315 aa  45.8  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0323  hypothetical protein  31.11 
 
 		 109 aa  45.4  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.814901 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1235  transcriptional regulator, AraC family  30.59 
 
 		 282 aa  44.3  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.593995  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2801  cupin 2 domain-containing protein  40.62 
 
 		 105 aa  44.3  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.125759  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3999  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  30.19 
 
 		 476 aa  43.9  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3716  cupin 2, barrel  35.71 
 
 		 129 aa  43.9  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000701811  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0737  cupin 2 domain-containing protein  39.73 
 
 		 207 aa  43.5  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2629  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.31 
 
 		 138 aa  43.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  28.46 
 
 		 137 aa  43.1  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1227  mannose-1-phosphate guanylyltransferase, interruption-C  27.27 
 
 		 257 aa  43.1  0.006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.192593  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6281  hypothetical protein  32.08 
 
 		 149 aa  42.7  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4841  cupin 2 domain-containing protein  22.62 
 
 		 202 aa  42.7  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 292 aa  42.4  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3672  cupin 2 domain-containing protein  36.78 
 
 		 128 aa  42.4  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>