75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1222 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1222  actinorhodin polyketide synthase bifunctional cyclase/dehydratase  100 
 
 		 314 aa  637    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.521023  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3550  cyclase/dehydrase  64.44 
 
 		 316 aa  421  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4143  actinorhodin polyketide synthase bifunctional cyclase/dehydratase  57.88 
 
 		 318 aa  364  1e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2197  cyclase/dehydrase  59.34 
 
 		 319 aa  348  9e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2780  cyclase/dehydrase  48.38 
 
 		 340 aa  279  4e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168913  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4098  actinorhodin polyketide synthase bifunctional cyclase/dehydratase  49.51 
 
 		 319 aa  278  6e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6488  actinorhodin polyketide synthase bifunctional cyclase/dehydratase  43.55 
 
 		 330 aa  233  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4151  actinorhodin polyketide synthase bifunctional cyclase/dehydratase  39.59 
 
 		 315 aa  196  6e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0149  Polyketide cyclase/dehydrase  28.08 
 
 		 167 aa  55.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2686  cyclase/dehydrase  29.49 
 
 		 239 aa  54.3  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.166242  hitchhiker  0.000545483 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2853  cyclase/dehydrase  26.71 
 
 		 162 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4153  hypothetical protein  26.95 
 
 		 160 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0556461  decreased coverage  0.00228502 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2502  cyclase/dehydrase  28.85 
 
 		 239 aa  53.1  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2391  cyclase/dehydrase  26.76 
 
 		 164 aa  53.1  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.290127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1089  cyclase/dehydrase  25.52 
 
 		 151 aa  50.4  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33720  polyketide cyclase / dehydrase family protein  27.46 
 
 		 155 aa  50.1  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0757  cyclase/dehydrase  28.42 
 
 		 144 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323423 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4270  Polyketide cyclase/dehydrase  27.78 
 
 		 157 aa  49.3  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259167  normal  0.925027 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4733  cyclase/dehydrase  27.37 
 
 		 144 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.476738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4598  cyclase/dehydrase  27.37 
 
 		 144 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.762203  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4513  hypothetical protein  24.79 
 
 		 157 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.334417  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4201  cyclase/dehydrase  27.37 
 
 		 144 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.546802 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0505  hypothetical protein  22.22 
 
 		 175 aa  47.8  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1269  cyclase/dehydrase  26.26 
 
 		 143 aa  47.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.858144  normal  0.121597 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004299  putative oligoketide cyclase/lipid transport protein  24.55 
 
 		 147 aa  48.5  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2739  hypothetical protein  25.71 
 
 		 143 aa  47.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000766301  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4732  cyclase/dehydrase  27.37 
 
 		 182 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.22786  normal  0.0214019 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43040  hypothetical protein  29.29 
 
 		 144 aa  47.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2900  hypothetical protein  25.71 
 
 		 158 aa  47  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1474  hypothetical protein  25.25 
 
 		 145 aa  47  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2902  hypothetical protein  25.71 
 
 		 158 aa  47  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.51613 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1230  cyclase/dehydrase  25.25 
 
 		 145 aa  47  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2882  hypothetical protein  25.71 
 
 		 158 aa  47  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2832  hypothetical protein  25.71 
 
 		 158 aa  47  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0555762  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3014  hypothetical protein  25.71 
 
 		 158 aa  47  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2775  cyclase/dehydrase  25.25 
 
 		 145 aa  46.6  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0618615 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2951  cyclase/dehydrase  25.25 
 
 		 145 aa  46.6  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2853  cyclase/dehydrase  25.25 
 
 		 145 aa  46.6  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3333  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.66 
 
 		 294 aa  46.2  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0663795  normal  0.136427 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0700  cyclase/dehydrase  26.32 
 
 		 144 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220634  hitchhiker  0.0000821406 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3051  cyclase/dehydrase  25.25 
 
 		 145 aa  45.8  0.0009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.247309 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1299  cyclase/dehydrase  25.25 
 
 		 145 aa  45.8  0.0009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1308  cyclase/dehydrase  25.25 
 
 		 145 aa  45.8  0.0009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1335  cyclase/dehydrase  25.25 
 
 		 145 aa  45.8  0.0009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01125  hypothetical protein  22.73 
 
 		 147 aa  45.8  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1257  cyclase/dehydrase  24.07 
 
 		 146 aa  44.3  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0922177  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2777  hypothetical protein  25.71 
 
 		 145 aa  44.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000964625  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3008  hypothetical protein  24.55 
 
 		 145 aa  45.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00761479  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2551  cyclase/dehydrase  24.07 
 
 		 146 aa  44.3  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422597 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2771  hypothetical protein  24.55 
 
 		 158 aa  45.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.117856  normal  0.130491 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3689  hypothetical protein  29.81 
 
 		 144 aa  45.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0488001  normal  0.176702 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2903  hypothetical protein  24.55 
 
 		 145 aa  45.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.247962  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0375  hypothetical protein  23.3 
 
 		 146 aa  43.9  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.66148  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1056  cyclase/dehydrase  24.55 
 
 		 158 aa  44.3  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.454837  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02471  hypothetical protein  24.55 
 
 		 158 aa  44.3  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.19522  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1392  oligoketide cyclase/lipid transport protein  32 
 
 		 146 aa  43.9  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000575207  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3859  hypothetical protein  24.55 
 
 		 158 aa  44.3  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0524065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1065  hypothetical protein  24.55 
 
 		 158 aa  44.3  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.341298  normal  0.549802 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1283  cyclase/dehydrase  23.24 
 
 		 143 aa  44.3  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.106424  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1454  polyketide cyclase/dehydrase family protein  32 
 
 		 146 aa  43.9  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000012561  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02507  hypothetical protein  24.55 
 
 		 158 aa  44.3  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1621  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1603  cyclase/dehydrase  21.21 
 
 		 145 aa  43.5  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.555415 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3100  cyclase/dehydrase  24.35 
 
 		 146 aa  43.5  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2387  hypothetical protein  26.21 
 
 		 144 aa  43.5  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.873235  normal  0.259077 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1521  cyclase/dehydrase  23.23 
 
 		 145 aa  43.5  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351498  hitchhiker  0.00471507 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3950  hypothetical protein  28.16 
 
 		 157 aa  43.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.308895  normal  0.373552 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3099  hypothetical protein  26.67 
 
 		 158 aa  42.7  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.31721  normal  0.377691 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0725  hypothetical protein  25.25 
 
 		 148 aa  43.1  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.242163  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1832  cyclase/dehydrase  28.93 
 
 		 155 aa  42.7  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491561  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1095  cyclase/dehydrase  25.25 
 
 		 144 aa  42.7  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.157987  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1908  cyclase/dehydrase  27.18 
 
 		 143 aa  42.7  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2698  cyclase/dehydrase  30.77 
 
 		 148 aa  42.7  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0875708  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2128  hypothetical protein  30 
 
 		 150 aa  42.4  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1408  cyclase/dehydrase  23.23 
 
 		 143 aa  42.7  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3828  aromatic rich family protein  23.48 
 
 		 146 aa  42.4  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372511  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>