71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3550 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3550  cyclase/dehydrase  100 
 
 		 316 aa  651    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1222  actinorhodin polyketide synthase bifunctional cyclase/dehydratase  64.44 
 
 		 314 aa  421  1e-117  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.521023  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4143  actinorhodin polyketide synthase bifunctional cyclase/dehydratase  61.27 
 
 		 318 aa  391  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2197  cyclase/dehydrase  55.73 
 
 		 319 aa  339  2.9999999999999998e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2780  cyclase/dehydrase  47.45 
 
 		 340 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168913  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4098  actinorhodin polyketide synthase bifunctional cyclase/dehydratase  42.38 
 
 		 319 aa  252  6e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6488  actinorhodin polyketide synthase bifunctional cyclase/dehydratase  39.62 
 
 		 330 aa  207  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4151  actinorhodin polyketide synthase bifunctional cyclase/dehydratase  36.77 
 
 		 315 aa  183  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2391  cyclase/dehydrase  24.65 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.290127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2853  cyclase/dehydrase  25.87 
 
 		 162 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004299  putative oligoketide cyclase/lipid transport protein  25.23 
 
 		 147 aa  53.9  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3333  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.11 
 
 		 294 aa  52.8  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0663795  normal  0.136427 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2686  cyclase/dehydrase  27.08 
 
 		 239 aa  53.1  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.166242  hitchhiker  0.000545483 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33720  polyketide cyclase / dehydrase family protein  27.59 
 
 		 155 aa  52.8  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01125  hypothetical protein  24.32 
 
 		 147 aa  51.2  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1089  cyclase/dehydrase  25.71 
 
 		 151 aa  50.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2502  cyclase/dehydrase  29.17 
 
 		 239 aa  50.4  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3689  hypothetical protein  23.42 
 
 		 144 aa  50.1  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0488001  normal  0.176702 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1269  cyclase/dehydrase  25.71 
 
 		 143 aa  50.1  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.858144  normal  0.121597 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4598  cyclase/dehydrase  24.04 
 
 		 144 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.762203  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4733  cyclase/dehydrase  24.04 
 
 		 144 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.476738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43040  hypothetical protein  26.67 
 
 		 144 aa  48.9  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4153  hypothetical protein  24.46 
 
 		 160 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0556461  decreased coverage  0.00228502 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0700  cyclase/dehydrase  24.04 
 
 		 144 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220634  hitchhiker  0.0000821406 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01810  cyclase/dehydrase  21.5 
 
 		 146 aa  48.1  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000564706  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2882  hypothetical protein  22.12 
 
 		 158 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2902  hypothetical protein  22.12 
 
 		 158 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.51613 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2900  hypothetical protein  22.12 
 
 		 158 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3014  hypothetical protein  22.12 
 
 		 158 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2832  hypothetical protein  22.12 
 
 		 158 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0555762  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1474  hypothetical protein  24.3 
 
 		 145 aa  48.1  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2775  cyclase/dehydrase  24.3 
 
 		 145 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0618615 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1603  cyclase/dehydrase  22.43 
 
 		 145 aa  47.8  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.555415 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2951  cyclase/dehydrase  24.3 
 
 		 145 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0725  hypothetical protein  22.43 
 
 		 148 aa  47.8  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.242163  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4732  cyclase/dehydrase  24.04 
 
 		 182 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.22786  normal  0.0214019 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2853  cyclase/dehydrase  24.3 
 
 		 145 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2387  hypothetical protein  26.13 
 
 		 144 aa  47.4  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.873235  normal  0.259077 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0149  Polyketide cyclase/dehydrase  26.03 
 
 		 167 aa  47  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1095  cyclase/dehydrase  22.52 
 
 		 144 aa  46.6  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.157987  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0757  cyclase/dehydrase  24.04 
 
 		 144 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323423 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0375  hypothetical protein  22.52 
 
 		 146 aa  45.4  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.66148  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1335  cyclase/dehydrase  23.36 
 
 		 145 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1283  cyclase/dehydrase  21.62 
 
 		 143 aa  44.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.106424  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1408  cyclase/dehydrase  25.23 
 
 		 143 aa  45.1  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3051  cyclase/dehydrase  23.36 
 
 		 145 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.247309 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0505  hypothetical protein  19.82 
 
 		 175 aa  44.7  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1299  cyclase/dehydrase  23.36 
 
 		 145 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1230  cyclase/dehydrase  22.43 
 
 		 145 aa  45.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1308  cyclase/dehydrase  23.36 
 
 		 145 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4270  Polyketide cyclase/dehydrase  33.82 
 
 		 157 aa  44.3  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259167  normal  0.925027 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3828  aromatic rich family protein  22.33 
 
 		 146 aa  44.3  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372511  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2739  hypothetical protein  20.72 
 
 		 143 aa  44.3  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000766301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1521  cyclase/dehydrase  20.95 
 
 		 145 aa  43.9  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351498  hitchhiker  0.00471507 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2771  hypothetical protein  20.98 
 
 		 158 aa  43.9  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.117856  normal  0.130491 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1366  cyclase/dehydrase  24.55 
 
 		 145 aa  43.5  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0960  hypothetical protein  25.93 
 
 		 148 aa  43.5  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02507  hypothetical protein  20.98 
 
 		 158 aa  43.5  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1621  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3221  cyclase/dehydrase  25.66 
 
 		 144 aa  43.5  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02471  hypothetical protein  20.98 
 
 		 158 aa  43.5  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.19522  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1056  cyclase/dehydrase  20.98 
 
 		 158 aa  43.5  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.454837  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1065  hypothetical protein  20.98 
 
 		 158 aa  43.5  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.341298  normal  0.549802 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2892  hypothetical protein  20.72 
 
 		 144 aa  43.5  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000179242  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1240  cyclase/dehydrase  23.42 
 
 		 145 aa  43.1  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.929537  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1373  hypothetical protein  20.72 
 
 		 144 aa  42.7  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000244514  normal  0.0546324 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1408  cyclase/dehydrase  20.95 
 
 		 143 aa  42.7  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1302  cyclase/dehydrase  24.55 
 
 		 145 aa  42.7  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.34428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2979  hypothetical protein  20.72 
 
 		 144 aa  42.7  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.587752  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3301  cyclase/dehydrase  21.62 
 
 		 144 aa  42.7  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.642238  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5308  cyclase/dehydrase  24.78 
 
 		 145 aa  42.7  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.225873  normal  0.133474 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3859  hypothetical protein  20.28 
 
 		 158 aa  42.4  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0524065  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>