12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4143 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4143  actinorhodin polyketide synthase bifunctional cyclase/dehydratase  100 
 
 		 318 aa  645    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3550  cyclase/dehydrase  61.27 
 
 		 316 aa  391  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1222  actinorhodin polyketide synthase bifunctional cyclase/dehydratase  57.88 
 
 		 314 aa  364  1e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.521023  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2197  cyclase/dehydrase  58.6 
 
 		 319 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2780  cyclase/dehydrase  49.21 
 
 		 340 aa  289  4e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168913  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4098  actinorhodin polyketide synthase bifunctional cyclase/dehydratase  44.05 
 
 		 319 aa  252  5.000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6488  actinorhodin polyketide synthase bifunctional cyclase/dehydratase  39.68 
 
 		 330 aa  204  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4151  actinorhodin polyketide synthase bifunctional cyclase/dehydratase  36.33 
 
 		 315 aa  180  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3333  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.99 
 
 		 294 aa  54.3  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0663795  normal  0.136427 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2391  cyclase/dehydrase  26.39 
 
 		 164 aa  50.4  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.290127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2853  cyclase/dehydrase  27.03 
 
 		 162 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0149  Polyketide cyclase/dehydrase  27.15 
 
 		 167 aa  47.8  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>