16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2853 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2853  cyclase/dehydrase  100 
 
 		 162 aa  337  5e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2391  cyclase/dehydrase  76.83 
 
 		 164 aa  255  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.290127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0149  Polyketide cyclase/dehydrase  68.24 
 
 		 167 aa  217  6e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2686  cyclase/dehydrase  62.42 
 
 		 239 aa  209  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.166242  hitchhiker  0.000545483 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2502  cyclase/dehydrase  62.42 
 
 		 239 aa  205  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1089  cyclase/dehydrase  60.26 
 
 		 151 aa  196  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4153  hypothetical protein  60.69 
 
 		 160 aa  191  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0556461  decreased coverage  0.00228502 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33720  polyketide cyclase / dehydrase family protein  58.67 
 
 		 155 aa  187  5e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3333  Cupin 2 conserved barrel domain protein  56.94 
 
 		 294 aa  154  4e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0663795  normal  0.136427 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4270  Polyketide cyclase/dehydrase  47.97 
 
 		 157 aa  145  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259167  normal  0.925027 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3550  cyclase/dehydrase  25.87 
 
 		 316 aa  55.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1222  actinorhodin polyketide synthase bifunctional cyclase/dehydratase  26.71 
 
 		 314 aa  53.9  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.521023  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2197  cyclase/dehydrase  25.5 
 
 		 319 aa  48.5  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4143  actinorhodin polyketide synthase bifunctional cyclase/dehydratase  27.03 
 
 		 318 aa  47.8  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0596  cyclase/dehydrase  25.9 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0022  cyclase/dehydrase  26.61 
 
 		 155 aa  43.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>