17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4153 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4153  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  330  5e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0556461  decreased coverage  0.00228502 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1089  cyclase/dehydrase  64.43 
 
 		 151 aa  208  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2686  cyclase/dehydrase  62.34 
 
 		 239 aa  202  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.166242  hitchhiker  0.000545483 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2853  cyclase/dehydrase  61.07 
 
 		 162 aa  196  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33720  polyketide cyclase / dehydrase family protein  61.07 
 
 		 155 aa  194  3e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2502  cyclase/dehydrase  60.39 
 
 		 239 aa  191  4e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2391  cyclase/dehydrase  60 
 
 		 164 aa  189  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.290127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0149  Polyketide cyclase/dehydrase  60.53 
 
 		 167 aa  188  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3333  Cupin 2 conserved barrel domain protein  58.82 
 
 		 294 aa  163  8e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0663795  normal  0.136427 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4270  Polyketide cyclase/dehydrase  50.67 
 
 		 157 aa  163  9e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259167  normal  0.925027 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1222  actinorhodin polyketide synthase bifunctional cyclase/dehydratase  26.9 
 
 		 314 aa  55.5  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.521023  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2197  cyclase/dehydrase  28.38 
 
 		 319 aa  50.4  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3550  cyclase/dehydrase  24.46 
 
 		 316 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164951  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07010  hypothetical protein  23.03 
 
 		 343 aa  42  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1437  cyclase/dehydrase  27.47 
 
 		 166 aa  41.6  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00296077  hitchhiker  0.00000517245 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43040  hypothetical protein  26 
 
 		 144 aa  41.2  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0757  cyclase/dehydrase  22.55 
 
 		 144 aa  40.8  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323423 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>