14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_33720 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_33720  polyketide cyclase / dehydrase family protein  100 
 
 		 155 aa  323  6e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1089  cyclase/dehydrase  60.93 
 
 		 151 aa  195  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4153  hypothetical protein  61.38 
 
 		 160 aa  191  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0556461  decreased coverage  0.00228502 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2686  cyclase/dehydrase  59.72 
 
 		 239 aa  189  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.166242  hitchhiker  0.000545483 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2502  cyclase/dehydrase  56.86 
 
 		 239 aa  188  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2853  cyclase/dehydrase  58.67 
 
 		 162 aa  187  5e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0149  Polyketide cyclase/dehydrase  52.98 
 
 		 167 aa  176  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2391  cyclase/dehydrase  56.55 
 
 		 164 aa  174  6e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.290127  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3333  Cupin 2 conserved barrel domain protein  53.79 
 
 		 294 aa  147  5e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0663795  normal  0.136427 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4270  Polyketide cyclase/dehydrase  42.18 
 
 		 157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259167  normal  0.925027 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2197  cyclase/dehydrase  28.86 
 
 		 319 aa  54.7  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3550  cyclase/dehydrase  27.59 
 
 		 316 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1222  actinorhodin polyketide synthase bifunctional cyclase/dehydratase  27.46 
 
 		 314 aa  50.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.521023  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43040  hypothetical protein  22.9 
 
 		 144 aa  42  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>