20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4270 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4270  Polyketide cyclase/dehydrase  100 
 
 		 157 aa  324  3e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259167  normal  0.925027 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1089  cyclase/dehydrase  48.65 
 
 		 151 aa  159  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4153  hypothetical protein  49.66 
 
 		 160 aa  157  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0556461  decreased coverage  0.00228502 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2686  cyclase/dehydrase  46.58 
 
 		 239 aa  148  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.166242  hitchhiker  0.000545483 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2853  cyclase/dehydrase  47.97 
 
 		 162 aa  145  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0149  Polyketide cyclase/dehydrase  47.74 
 
 		 167 aa  143  8.000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2502  cyclase/dehydrase  44.76 
 
 		 239 aa  140  6e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2391  cyclase/dehydrase  47.59 
 
 		 164 aa  139  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.290127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33720  polyketide cyclase / dehydrase family protein  42.18 
 
 		 155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3333  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.3 
 
 		 294 aa  124  6e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0663795  normal  0.136427 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1222  actinorhodin polyketide synthase bifunctional cyclase/dehydratase  27.78 
 
 		 314 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.521023  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2197  cyclase/dehydrase  27.03 
 
 		 319 aa  48.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3550  cyclase/dehydrase  33.82 
 
 		 316 aa  44.3  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1484  cyclase/dehydrase  32.5 
 
 		 148 aa  44.3  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.72758  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0757  cyclase/dehydrase  24.64 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323423 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2531  hypothetical protein  27.81 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0544904  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3955  cyclase/dehydrase  40 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.038977  normal  0.82843 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4513  hypothetical protein  25 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.334417  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3431  cyclase/dehydrase  38.18 
 
 		 149 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2685  cyclase/dehydrase  38.18 
 
 		 149 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>