22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2531 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2531  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  313  4e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0544904  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2529  hypothetical protein  84.78 
 
 		 46 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.124196  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2018  hypothetical protein  28.77 
 
 		 371 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1413  hypothetical protein  28.77 
 
 		 371 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37130  hypothetical protein  32.08 
 
 		 378 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000362882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1041  hypothetical protein  28.77 
 
 		 367 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.117784  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1328  putative lipoprotein  28.77 
 
 		 367 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3199  putative lipoprotein  28.77 
 
 		 367 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.160296  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3072  hypothetical protein  28.77 
 
 		 371 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2308  putative lipoprotein  28.77 
 
 		 367 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2307  hypothetical protein  29.45 
 
 		 371 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4200  hypothetical protein  28.28 
 
 		 181 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0571249 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3576  hypothetical protein  28.99 
 
 		 178 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.764191 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2125  MxaD gene product  26.22 
 
 		 176 aa  44.3  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0541429  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4270  Polyketide cyclase/dehydrase  27.81 
 
 		 157 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259167  normal  0.925027 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0975  hypothetical protein  28.57 
 
 		 369 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.727204  normal  0.153799 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1021  cyclase/dehydrase  26.42 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4332  hypothetical protein  37.66 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.305332  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3129  Fatty acid hydroxylase  30.84 
 
 		 381 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0424  Hsp90 ATPase activator family protein  30.34 
 
 		 163 aa  40.8  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2898  hypothetical protein  33.02 
 
 		 149 aa  40.8  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104523  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12594  hypothetical protein  24.81 
 
 		 167 aa  40  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.597644 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>