76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_2685 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2685  cyclase/dehydrase  100 
 
 
149 aa  300  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3431  cyclase/dehydrase  100 
 
 
149 aa  300  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0678  cyclase/dehydrase  81.08 
 
 
148 aa  260  4e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3955  cyclase/dehydrase  75.51 
 
 
152 aa  242  9.999999999999999e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.038977  normal  0.82843 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0199  cyclase/dehydrase  72.79 
 
 
151 aa  238  2.9999999999999997e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4789  cyclase/dehydrase  71.72 
 
 
147 aa  230  5e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.799233  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1511  hypothetical protein  75.71 
 
 
145 aa  223  8e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.399595  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3177  cyclase/dehydrase  71.03 
 
 
151 aa  220  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2355  hypothetical protein  50.7 
 
 
145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26201  putative integral membrane protein  47.89 
 
 
149 aa  144  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.52339 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0336  hypothetical protein  47.18 
 
 
146 aa  143  8.000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1483  putative integral membrane protein  42.47 
 
 
150 aa  135  2e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.77346  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01301  putative integral membrane protein  39.04 
 
 
157 aa  130  7.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.561031 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01881  putative integral membrane protein  41.1 
 
 
150 aa  130  7.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.560201  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01281  putative integral membrane protein  37.67 
 
 
156 aa  122  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.49008  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0117  putative integral membrane protein  36.99 
 
 
156 aa  121  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01321  putative integral membrane protein  36.99 
 
 
156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01311  putative integral membrane protein  36.99 
 
 
156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37514  predicted protein  33.1 
 
 
153 aa  94.4  5e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.458024 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3412  cyclase/dehydrase  30.56 
 
 
337 aa  70.9  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0957  cyclase/dehydrase  31.06 
 
 
170 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1018  cyclase/dehydrase  31.06 
 
 
159 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.665706  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1044  cyclase/dehydrase  32.64 
 
 
272 aa  66.2  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.214991  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1015  cyclase/dehydrase  31.82 
 
 
159 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0343567  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1527  cyclase/dehydrase  31.43 
 
 
181 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.626943  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3967  cyclase/dehydrase  28.47 
 
 
300 aa  64.7  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139128  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0307  cyclase/dehydrase  29.79 
 
 
303 aa  61.6  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1754  cyclase/dehydrase  27.15 
 
 
153 aa  59.7  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0123  cyclase/dehydrase  29.85 
 
 
243 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.764786 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0140  cyclase/dehydrase  28.68 
 
 
242 aa  58.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3678  cyclase/dehydrase  29.58 
 
 
216 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0898363  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1003  cyclase/dehydrase  27.66 
 
 
156 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109283  decreased coverage  0.00240737 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2623  cyclase/dehydrase  28.15 
 
 
244 aa  57.8  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.502552 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5344  cyclase/dehydrase  33.81 
 
 
187 aa  57.8  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0114  cyclase/dehydrase  33.33 
 
 
225 aa  57.8  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2639  cyclase/dehydrase  28.36 
 
 
162 aa  57  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.697167  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0577  cyclase/dehydrase  31.94 
 
 
241 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3785  cyclase/dehydrase  25.71 
 
 
223 aa  56.6  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.720369  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3009  cyclase/dehydrase  31.78 
 
 
256 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000149284 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0007  cyclase/dehydrase  29.55 
 
 
160 aa  55.5  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2865  cyclase/dehydrase  28.78 
 
 
143 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5444  cyclase/dehydrase  30.71 
 
 
164 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252579  normal  0.482853 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4497  cyclase/dehydrase  32.84 
 
 
232 aa  54.7  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1801  cyclase/dehydrase  28.38 
 
 
205 aa  54.3  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43619  predicted protein  23.78 
 
 
241 aa  53.9  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1350  cyclase/dehydrase  30.43 
 
 
238 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0825  cyclase/dehydrase  26.67 
 
 
152 aa  52.4  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.987427  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3433  cyclase/dehydrase  25.53 
 
 
155 aa  52.4  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.151513  hitchhiker  0.00285229 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0413  hypothetical protein  28.97 
 
 
231 aa  52.8  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.239427  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3684  cyclase/dehydrase  31.79 
 
 
219 aa  52.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15860  polyketide cyclase / dehydrase family protein  27.46 
 
 
156 aa  51.6  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00215892  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3103  hypothetical protein  32.12 
 
 
212 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.602873  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6283  cyclase/dehydrase  30.94 
 
 
240 aa  51.2  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000939789  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0103  cyclase/dehydrase  24.67 
 
 
203 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3832  cyclase/dehydrase  33.05 
 
 
212 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.341531 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0297  cyclase/dehydrase  27.82 
 
 
210 aa  50.4  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7248  integral membrane protein-like protein  27.27 
 
 
232 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0202449  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1740  cyclase/dehydrase  24.65 
 
 
153 aa  49.3  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.294422  decreased coverage  0.000862073 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_11048  predicted protein  31.9 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2654  cyclase/dehydrase  27.52 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0994  cyclase/dehydrase  26.24 
 
 
164 aa  47  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.864114  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3664  hypothetical protein  31.39 
 
 
214 aa  47  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.321126 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3666  cyclase/dehydrase  29.25 
 
 
284 aa  47  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470859  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3216  cyclase/dehydrase  27.78 
 
 
162 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0812  cyclase/dehydrase  26.12 
 
 
217 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.714265  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3430  cyclase/dehydrase  29.5 
 
 
239 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1322  cyclase/dehydrase  27.89 
 
 
237 aa  45.4  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1407  cyclase/dehydrase  27.91 
 
 
197 aa  46.2  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1111  cyclase/dehydrase  27.64 
 
 
162 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4844  cyclase/dehydrase  24.06 
 
 
328 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.327815  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6540  cyclase/dehydrase  24.06 
 
 
287 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472702  normal  0.0557794 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2801  cyclase/dehydrase  23.08 
 
 
145 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0725635  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4270  Polyketide cyclase/dehydrase  38.18 
 
 
157 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259167  normal  0.925027 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2872  hypothetical protein  24.46 
 
 
144 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2916  cyclase/dehydrase  24.46 
 
 
144 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.790251  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2902  cyclase/dehydrase  24.46 
 
 
144 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.850178 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>